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血管内皮生长因子及其受体在人皮肤黑素瘤的组学数据分析
血管内皮生长因子及其受体在人皮肤黑素瘤的组学数据分析
作者:
姚战非
张雪梅
马枞
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
黑素瘤
血管内皮生长因子
生物信息学分析
突变
临床预后
摘要:
目的 研究血管内皮生长因子(VEGFA、VEGFB)及其受体KDR、FLT1在人皮肤黑素瘤中的基因组学、转录组学变异及其与临床预后的相关性.方法 利用TC-GA数据库,分析VEGFA、VEGFB及其受体KDR、FLT1的基因组学、转录组学突变频谱及其变化与临床预后的相关性;通过生物信息学筛选其共同相关基因,探索其可能的分子机制.结果 在TCGA数据库同时具备基因组信息和转录组信息的287例黑素瘤样本中,VEGFA基因突变率为5.92%,VEGFB突变率为2.09%,KDR突变率为16.72%,FLT1突变率为12.54%,其突变与黑素瘤患者生存期无明显关系,转录组数据显示VEGFA mRNA表达上调率为3.48%,VEGFB mRNA表达上调率为3.83%,KDR mRNA表达上调率为2.09%,FLT1 mRNA表达上调率为3.83%,VEGFB表达上调与患者临床预后显著相关,表达上调和表达无变化者生存中位数分别为33.9个月和94.91个月(P=6.870e-4),VEGFA和KDR表达上调对患者预后有影响趋势,但差异无统计学意义.生物信息学分析显示CMTM1、QKI、BACH1可能是影响VEGFA/B作用的关键基因,提示其可能作为抗血管生成治疗的靶位点.结论 VEGFA、VEGFB及其受体KDR、FLT1在人黑素瘤中存在着拷贝数扩增和表达量的显著上调,VEGFB的变化与患者临床预后显著相关,提示其可能在黑素瘤的血管生成中发挥着重要作用.本研究为临床黑素瘤的治疗提供了有益线索.
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篇名
血管内皮生长因子及其受体在人皮肤黑素瘤的组学数据分析
来源期刊
中国皮肤性病学杂志
学科
医学
关键词
黑素瘤
血管内皮生长因子
生物信息学分析
突变
临床预后
年,卷(期)
2019,(6)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
628-633
页数
6页
分类号
R739.5
字数
语种
中文
DOI
10.13735/j.cjdv.1001-7089.201807105
五维指标
作者信息
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姓名
单位
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1
张雪梅
内蒙古民族大学附属医院
21
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姚战非
内蒙古民族大学附属医院
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马枞
内蒙古民族大学附属医院
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传播情况
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研究主题发展历程
节点文献
黑素瘤
血管内皮生长因子
生物信息学分析
突变
临床预后
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国皮肤性病学杂志
主办单位:
西安交通大学
出版周期:
月刊
ISSN:
1001-7089
CN:
61-1197/R
开本:
大16开
出版地:
陕西省西安市西五路157号
邮发代号:
52-17
创刊时间:
1987
语种:
chi
出版文献量(篇)
9358
总下载数(次)
21
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