硝化微生物富集及其种群结构与基因表达分析

• 作者: 余晨笛 侯立军 刘敏 刘程 尹国宇 常永凯 郑艳玲 高娟
• 来源期刊: 华东师范大学学报（自然科学版）
• 学科: 地球科学
• 关键词: 硝化微生物 富集培养 潮滩沉积物 种群丰度 基因表达
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 生态与环境科学
• 页码范围: 164-173
• 页数: 10页
• 分类号: X172
• 字数: 5452字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-5641.2019.03.018

摘要

对采集的长江口潮滩沉积物进行了硝化微生物的富集培养,通过宏基因组技术分析了富集物中硝化微生物的种群结构.检测到4类硝化微生物(占测序总reads的34.7％),包括新近发现的全程氨氧化微生物(complete ammonia oxidizers,comammox)、严格的亚硝酸盐氧化菌Nitrospira、β-变形菌门氨氧化细菌及氨氧化古菌.其中,comammox占硝化微生物类群的48％.此外,基于宏转录组技术分析了4类硝化菌群的基因表达特征(依据Evolutionary genealogy of genes:Non-supervised Orthologous Groups数据库).研究探讨了潮滩沉积物富集物中硝化微生物的种群结构与基因表达特征,证明了长江口潮滩沉积环境中comammox的存在,并验证了其基因表达活性.研究结果加深了对河口地区硝化微生物的认识,对于未来硝化过程的分子生态学研究有重要启示意义.