采用RAPD-PCR技术评估果蝇肠道噬菌体多样性

• 作者: 孙浩 徐慧 杜蓓蓓 杨伟超 董玉玲
• 来源期刊: 生态学杂志
• 关键词: 肠道病毒 多样性 RAPD 黑腹果蝇
• 年，卷（期）: 2019,（11）
• 所属期刊栏目: 方法与技术
• 页码范围: 3560-3566
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13292/j.1000-4890.201911.005

摘要

噬菌体作为微生物群落结构和功能的主要驱动力之一,研究其在动物肠道中的生态进化过程具有重要意义.本研究以黑腹果蝇为模型,探究以随机多态性DNA聚合酶链式反应(RAPD-PCR)病毒指纹技术评估肠道噬菌体的多样性.结果 表明,野生型黑腹果蝇肠道噬菌体的多样性高于InR突变体黑腹果蝇.InR突变体果蝇在孵化为成虫后,可能经历一段短期的肠道噬菌体扰动,与第3天相比,第15天的肠道噬菌体多样性显著降低,而健康的野生型果蝇则没有明显变化.进一步利用落射荧光显微镜测量噬菌体和细菌的丰度,在第3天和15天,野生型果蝇游离噬菌体和细菌均处于稳定状态.第3天InR突变体果蝇肠道细菌的丰度显著降低,病毒与细菌丰度的比值(VBR)明显高于其他组;第15天InR突变型果蝇噬菌体的多样性降低,VBR明显低于各处理组.本文证实了InR突变体果蝇肠道噬菌体生态学特征与野生型存在一定的差异,也表明RAPD-PCR病毒指纹技术可以实现对肠道病毒多样性的快速评估.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐慧	中国科学院沈阳应用生态研究所	83	1272	19.0	33.0
2	杨伟超	中国科学院沈阳应用生态研究所	17	107	5.0	10.0
3	孙浩	中国科学院沈阳应用生态研究所	29	72	4.0	6.0
4	杜蓓蓓	中国科学院沈阳应用生态研究所	2	0	0.0	0.0
8	董玉玲	中国科学院沈阳应用生态研究所	3	3	1.0	1.0