变形假单胞菌葡萄糖酸脱氢酶操纵子的克隆与分析

• 作者: 孙文敬 孙雷 宋玉玲 崔凤杰 王大明 齐向辉
• 来源期刊: 食品科技
• 学科: 工学
• 关键词: 变形假单胞菌 葡萄糖酸脱氢酶 操纵子 克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2019,（7）
• 所属期刊栏目: 生物工程篇
• 页码范围: 43-49
• 页数: 7页
• 分类号: TS201.3
• 语种: 中文

摘要

该研究旨在明确变形假单胞菌JUIM01葡萄糖酸脱氢酶操纵子的结构及其基本的生物学信息.采用LA-PCR技术,从菌株JUIM01中克隆葡萄糖酸脱氢酶操纵子(gad操纵子)的全长序列;利用在线生物信息学工具,对克隆的序列进行分析;通过对变形假单胞菌膜结合葡萄糖酸脱氢酶的组成和结构分析,初步验证克隆和序列分析的结果.研究结果表明,变形假单胞菌gad操纵子具有3个结构基因gndS、gndL和gndC,分别编码膜结合葡萄糖酸脱氢酶的3个亚基.变形假单胞菌gndS基因与解淀粉欧文氏菌CFBP1430葡萄糖酸脱氢酶小亚基的编码基因的序列一致性为59.89％,其编码的蛋白属于gluconate_2-dh3 superfamily,为跨膜蛋白;基因gndL与铜绿假单胞菌PAMH19葡萄糖酸脱氢酶大亚基的编码基因的序列一致性为77.68％,其编码的蛋白属于GMCoxred_C superfamily,为跨膜蛋白;基因gndC与香茅醇假单胞菌P3B5葡萄糖脱氢酶中亚基的编码基因的序列一致性达85.31％,其编码的蛋白属于CccA superfamily.该结果为变形假单胞菌葡萄糖酸脱氢酶的转录调控机制研究提供了一定的理论基础.