菠萝R2R3-MYB基因家族鉴定与表达分析

• 作者: 张治礼 胡福初 范鸿雁 郭利军 阮城城 陈哲
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 菠萝 R2R3-MYB 生物信息学 乙烯利 基因表达
• 年，卷（期）: 2019,（10）
• 所属期刊栏目: 热带植物基因组学与基因编辑专题
• 页码范围: 1958-1971
• 页数: 14页
• 分类号: S668.3
• 字数: 5099字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2019.10.008

摘要

R2R3-MYB转录因子参与植物众多生命活动的调控,在植物生长发育中至关重要.本研究采用生物信息学分析方法,从菠萝基因组中筛选鉴定R2R3-AcMYB转录因子,并对其基因结构、编码蛋白和系统进化进行了分析;基于转录组数据和荧光定量PCR分析,研究了乙烯利处理后菠萝顶端分生组织MYB基因的表达模式.研究结果显示,菠萝基因组含有103个R2R3-AcMYB转录因子,其中67个的基因结构组成为3(外显子)+2(内含子),17个为2(外显子)+1(内含子).103个R2R3-AcMYB蛋白中,有31个偏碱性,55个显酸性和17个呈中性.亚细胞定位预测显示,有67个编码蛋白定位于细胞质,20个定位于细胞核.保守基序分析发现,有91个R2R3-AcMYB的序列包含SANT结构的motif 1和motif 2.系统进化树分析表明,81个R2R3-AcMYB转录因子可以分别被归入18个亚组,其余22个R2R3-AcMYB转录因子则未能进行明确归类.基于转录组数据和荧光定量PCR分析结果,发现菠萝顶端分生组织中多个MYB基因的表达受到乙烯利的诱导或抑制,暗示这些基因可能参与了乙烯利诱导条件下菠萝生长发育(包括开花诱导等)调控.这些研究结果为进一步挖掘菠萝激素响应、生长发育和开花调控等基因,揭示菠萝生长发育调控机制提供了数据支持.