蕹菜耐受长时间高温后的miRNA分析

• 作者: 刘涛 尚维 李文静 王杏茹 赖钟雄 郭容芳 陈冰星
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 蕹菜 长时间高温 miR160 miR166 miR393
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 486-498
• 页数: 13页
• 分类号: S636.9
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2018-0497

摘要

miRNA是广泛存在于真核生物体内的一类长度为20 ～ 24 nt的小分子非编码RNA,在植物生长发育和逆境适应过程中发挥重要作用.蕹菜(Ipomoea aquatica)可以耐受长时间高温,而其miRNA还未被鉴定,其在耐受长时间高温后的作用还未知.以蕹菜耐热性强的品种‘泰国三叉’和耐热性差的品种‘柳叶’为材料,经42℃高温处理15 d后分别构建两个高质量sRNA库,经检测两个库中碱基质量值大于或等于30的序列数量均超过17.3 Mb,且‘泰国三叉’中24 nt的序列数量远远高于‘柳叶’.与蕹菜转录组比对分析后,分别得到1 363 258和1 629 209条序列,两个库共有的序列仅有1 047 133条(11.36％),说明耐热性不同的蕹菜中sRNA有很大差别.共鉴定出蕹菜中存在71个miRNA,其中差异表达的有22个,通过TargetFinder预测其靶基因,共得到233个靶基因.进一步以耐热性强的品种‘本地三叉’和耐热性弱的品种‘竹叶’为材料研究其在长时间高温后miR160、miR166、miR 172、miR393和miR3627前体的差异表达量,结果表明,高温后两品种中pre-miR 160-2的表达都显著上调,但是不耐热的‘竹叶’中上调的倍数更多;miR166在耐热性强的‘本地三叉’中表达量下降,在耐热性较差的‘竹叶’中表达量显著上升;miR172可以被长时间高温诱导,但在耐热性不同的两个品种蕹菜中并没有差异:miR3627的表达量在耐热蕹菜‘本地三叉’中下降,在不耐热蕹菜‘竹叶’中没有明显变化.miRNA前体表达模式的差异说明其在蕹菜耐受长时间高温过程中的作用机制不同.