纤维连接蛋白1在胃癌中的表达及临床意义

• 作者: 孙阳 赵春临
• 来源期刊: 医学研究生学报
• 学科: 医学
• 关键词: 胃癌 人类肿瘤相关基因表达汇编数据库 癌症基因组图谱数据库 纤维连接蛋白1 预后 基因集
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 629-633
• 页数: 5页
• 分类号: R735.2
• 字数: 2533字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16571/j.cnki.1008-8199.2019.06.014

摘要

目的 纤维连接蛋白1(FN1)参与癌症发生发展的机制尚不清楚.文章旨在研究FN1在胃癌组织中的表达和临床病理意义,并探讨FN1作用机制. 方法 采用人类肿瘤相关基因表达汇编(GEO)数据库和癌症基因组图谱(TCGA)数据库,下载GSE54129、GSE29272和TCGA数据分析胃癌与癌旁组织FN1的表达.根据TCGA表达谱数据及FN1表达分为:低表达(＜-0.475)、中表达(-0.475～1.036)、高表达(＞1.036).分析FN1在胃癌组织中的表达和临床病理关系;应用TCGA数据和Kaplan Meier在线分析FN1的表达水平与胃癌患者的预后关系;TCGA数据采用基因集富集分析(GSEA)方法预测FN1的相关通路. 结果 FN1低、中、高表达的中位生存时间分别为63.5、55.7和39.4个月,低表达和高表达者中位生存时间差异具有统计学意义(P＜0.01).Kaplan-Meier Plotter在线数据集分析结果显示,FN1高表达者中位生存时间短于低表达者(P＜0.01),即FN1表达越高,预后越差.FN1的表达是胃癌患者的独立预后因素(HR=0.480,95％CI:0.336～0.686).FN1高表达样本富集到KRAS(FDR=0.0025)、P53 (FDR=0.0052)、TGF-β(FDR=0.0052)、细胞黏附(FDR=0.0)、细胞外基质(FDR=0.0043)、骨架蛋白调控(FDR=0.0057)等基因集(P均＜0.01). 结论 FN1的高表达是胃癌预后不良的因素,可作为预测胃癌转移和预后的有效生物标志物.FN1高表达导致KRAS、P53、TGF-β、ECM、细胞黏附和细胞骨架蛋白调节通路异常可能是其作用机制.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵春临	郑州大学第一附属医院胃肠外科	62	207	8.0	11.0
2	孙阳	郑州大学第一附属医院胃肠外科	2	4	1.0	2.0