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巨峰葡萄Rs基因的克隆鉴定、序列分析与时空表达特征研究
巨峰葡萄Rs基因的克隆鉴定、序列分析与时空表达特征研究
作者:
崔腾飞
房经贵
王文然
王晨
白云赫
谭红雨
贾海锋
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
葡萄
Rs基因
克隆
序列与表达分析
摘要:
探究白藜芦醇合酶(Resveratrol synthase,Rs)在巨峰葡萄果实发育中的潜在作用.对其序列进行结构及功能分析,并鉴定其在果实不同发育时期的时空表达特异性.采用生物信息学分析及qRT-PCR的方法,对巨峰葡萄Rs基因序列进行分析,并对其结构和亚细胞定位进行预测,以及分析果实不同时期不同组织的表达情况.克隆得到的Rs基因cDNA全长1539 bp,开放阅读框(ORF)为1179 bp,编码392个氨基酸,预测蛋白分子质量42.88 ku,理论等电点(pI)为6.09,且该基因含有查耳酮和二苯乙烯合酶活性位点以及完整的芪合酶家族特征位点;蛋白互作预测发现,Rs和OMT2.1具有互作,后者可催化白藜芦醇生物合成紫檀芪;亚细胞预测结果表明,Rs基因主要在细胞质和叶绿体中表达;启动子分析发现,Rs基因表达可能受光照、MYB、真菌和激素的调控并存在一定的组织特异性.qRT-PCR表达分析显示,葡萄Rs基因在果皮和果肉中不同时期均有表达,但在花后25 d的青皮中表达量最高.结合Rs基因在白藜芦醇积累的作用,可以推测可能在果实发育前期的果皮中白藜芦醇有较高积累.巨峰葡萄Rs基因在进化过程中具有较高的保守性,其表达可能受环境、真菌和激素的调控且与OMT2.1具有互作效应.而且在不同的组织和时期存在一定的特异性.
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文献信息
篇名
巨峰葡萄Rs基因的克隆鉴定、序列分析与时空表达特征研究
来源期刊
华北农学报
学科
农学
关键词
葡萄
Rs基因
克隆
序列与表达分析
年,卷(期)
2019,(3)
所属期刊栏目
作物遗传育种·种质资源·生物技术
研究方向
页码范围
59-67
页数
9页
分类号
S663.1
字数
4796字
语种
中文
DOI
10.7668/hbnxb.201751391
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
房经贵
南京农业大学园艺学院
194
3087
29.0
47.0
2
贾海锋
南京农业大学园艺学院
21
102
6.0
9.0
3
王晨
南京农业大学园艺学院
69
628
15.0
22.0
4
白云赫
南京农业大学园艺学院
5
0
0.0
0.0
5
王文然
南京农业大学园艺学院
7
18
3.0
4.0
6
崔腾飞
南京农业大学园艺学院
3
9
1.0
3.0
7
谭红雨
中国农业大学食品科学与营养工程学院
1
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传播情况
被引次数趋势
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引文网络
引文网络
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节点文献
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研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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华北农学报
主办单位:
河北
北京
天津
山西
河南
内蒙古六省市农科院农学会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-7091
CN:
13-1101/S
开本:
大16开
出版地:
石家庄市和平西路598号
邮发代号:
18-10
创刊时间:
1986
语种:
chi
出版文献量(篇)
6276
总下载数(次)
4
总被引数(次)
88357
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华北农学报1998
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