基于转录组测序技术筛选花?卵巢发育相关基因

• 作者: 冯军厂 刘慧芬 卢良盛 周传江 李学军 王静 聂国兴 顾钱洪 马晓
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 花? 卵巢发育 转录组
• 年，卷（期）: 2019,（8）
• 页码范围: 1714-1722
• 页数: 9页
• 分类号: Q785|S917.4
• 字数: 5432字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11964/jfc.20180811419

摘要

为筛选影响花?卵巢发育相关的基因,采用Illumina Hiseq技术对花?脑、卵巢和肝脏组织进行高通量转录组测序.结果显示,3个组织分别产生了49484132、47540538和50622304个clean reads,组装后共获得了99878个unigenes,平均长度为1430 bp.DE seq分析发现,在脑vs.卵巢组中特异性表达的基因数为2305个,脑vs.肝脏组中特异性表达的基因数为839个,卵巢vs.肝脏组中特异性表达的基因数为1474个,3个比较组共有的差异表达基因数为860个.GO分析发现,上述差异表达基因主要集中在初级代谢过程(primary metabolic process)、单细胞过程(single-organism process)、有机物代谢过程(organic substance metabolic process)等生物学过程中.KEGG pathway分析显示,一些与卵巢发育和减数分裂相关的信号通路得到了显著富集,如GnRH信号通路、类固醇激素合成、TGF-β信号通路、卵母细胞减数分裂等代谢通路.本研究结果丰富了花?的基因资源,可为花?的繁殖生物学研究提供基础数据.