19群肺炎链球菌国家标准菌株分子特征分析及在菌株质量控制中的应用

• 作者: 叶强 徐潇 李康 王春娥 石继春 陈琼 陈翠萍 黄洋
• 来源期刊: 微生物学免疫学进展
• 学科: 医学
• 关键词: 19群肺炎链球菌 聚合酶链式反应血清分型 多位点序列分型 脉冲场凝胶电泳 质量控制
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 20-27
• 页数: 8页
• 分类号: R378.1+4
• 字数: 4646字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13309/j.cnki.pmi.2019.06.004

摘要

目的 明确19群肺炎链球菌(Streptococcus pneumoniae)国家标准菌株的分子特征,为完善中国肺炎链球菌国家标准菌株的质量标准提供依据.方法 在传统肺炎链球菌菌种检定方法的基础上,应用16S rRNA基因分析、聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)血清分型、多位点序列分型(multilocus sequence type,MLST)和脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis,PFGE)分型等多种分子生物学质控方法,对来源于中国医学细菌保藏管理中心的20株19群肺炎链球菌国家标准菌株进行分析.结果 20株19群肺炎链球菌的16S rRNA基因序列与肺炎链球菌模式株NCTC 7465的16S rRNA基因序列的相似性在99.64％ ～100％之间,碱基差异0～5 bp.PCR血清分型结果表明:11株19F型菌株均检测到大小为304 bp的19F型特异性扩增条带,6株19A型菌株均检测到大小为478 bp的19A型特异性扩增条带,PCR血清分型结果与血清凝集试验结果一致.MLST分型结果表明,相同血清型的菌株可以具有不同的序列型(sequence type,ST).共获得12个ST型,其中6个ST型(10496、10497、10501、10502、10503和10509)为首次报道.PFGE分型结果显示:各型别菌株各具有其特征性PFGE带型(9～17条带),相同血清型或ST型菌株可能具有不同的PFGE带型.共存在18种不同的PFGE带型,其中19F型和19A型菌株中各有一对菌株的ST型和PFGE图谱完全一致.菌株的传代稳定性考察结果显示:在25代以内31708菌株的PFGE带型未发生变化,遗传特征是稳定的.结论 16S rRNA基因分析、PCR血清分型、MLST分型和PFGE分型等分子生物学方法应用于中国肺炎链球菌国家标准菌株的质量控制,可获得更加全面的肺炎链球菌标准菌株身份信息数据(包括序列、PCR扩增片段、序列型、图谱等),为进一步完善中国肺炎链球菌国家标准菌株的质量标准提供依据和数据支撑.