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摘要:
目的 鼠肉瘤病毒致癌基因(Kirsten rat sarcoma viral oncogene,KRAS)突变型肺腺癌是临床常见肺癌亚型,发病机制不清,预后不良.推测可能与KRAS突变对整个基因组的影响有关.本研究通过对KRAS突变型肺腺癌的转录组分析,探讨其预后不良和耐药的组学机制.为研究KRAS突变型肺腺癌的发病机制和临床治疗提供指导.方法 从公共基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)中下载KRAS突变型肺腺癌的转录组数据库,首先利用R语言Impute程序包进行数据标准化,然后利用Limma程序包筛选差异基因,最后利用Robust rank aggregation算法筛选显著性基因.为进一步研究其表观调控机制,我们利用R语言Clusterprofile程序包和STRING数据库分别进行了KEGG pathway分析和蛋白质互作网络分析.结果KRAS突变对全转录组影响复杂,包括改变细胞周期促进肿瘤细胞异常增殖;影响白细胞介素-17信号通路促炎反应导致免疫耐受,促进肿瘤生长;影响细胞色素P450信号通路导致耐药.结论 KRAS 突变能够引起整个基因组发生异常变化,并与促进肿瘤生长、抑制抗肿瘤免疫以及耐药相关基因的表达密切相关.
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文献信息
篇名 KRAS突变对人肺腺癌转录组影响的生物信息学分析
来源期刊 转化医学杂志 学科 医学
关键词 KRAS突变 肺腺癌 转录组 生物信息学
年,卷(期) 2019,(2) 所属期刊栏目 基础研究
研究方向 页码范围 75-79
页数 5页 分类号 R734.2
字数 4058字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.2095-3097.2019.02.003
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转化医学杂志
双月刊
2095-3097
10-1042/R
大16开
北京市海淀区阜成路6号
1988
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