暗纹东方鲀sox9基因的克隆和组织表达分析

• 作者: 刘新富 刘滨 胡鹏 郭正龙 高莹莹
• 来源期刊: 上海海洋大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 暗纹东方鲀 sox9基因 cDNA克隆 生物信息学 组织表达
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 所属期刊栏目: 水产生物技术
• 页码范围: 835-847
• 页数: 13页
• 分类号: S917.4|Q786
• 语种: 中文
• DOI: 10.12024/jsou.20181202462

摘要

为初步探究暗纹东方鲀sox9基因在性腺发育和性别分化过程中的作用,通过设计兼并引物、RACE及荧光定量PCR技术,成功克隆出暗纹东方鲀sox9基因的cDNA全长序列,并分析其相应的生物信息学特征及其在雌雄个体的组织表达水平.结果表明:sox9a基因cDNA全长为1248 bp(NCBI登录号:MH218818),包括684 bp的ORF,编码227个氨基酸,297 bp的5'UTR和267 bp的3'UTR.sox9b基因全长为1941 bp(NCBI登录号:MH218819),包括1470 bp的ORF,编码489个氨基酸,306 bp的5'UTR和165 bp的3'UTR.同源性和系统发育分析结果表明暗纹东方鲀sox9基因与红鳍东方鲀同源性最高,亲缘关系最近.氨基酸多重序列比对结果显示两个Sox9氨基酸序列的HMG box结构域在哺乳动物和鱼类中均高度保守.荧光定量PCR分析显示两个sox9基因普遍存在于雌鱼和雄鱼的各个组织中,且均在雌鱼下丘脑中表达量最高,在精巢中有少量表达,卵巢中几乎不表达.总体来说,除少数组织外,两个sox9基因在雌鱼组织中的表达量普遍高于雄鱼.本研究为了解暗纹东方鲀sox9的遗传特性及相关的生理功能,探索性别分化与性腺发育的分子调控机制提供理论依据.