隐球菌脑膜炎患者脑脊液宏基因组二代测序结果分析

• 作者: 任海涛 关鸿志 吴红龙 宫燕萍 徐英春 申奥 窦洪涛 肖盟 范思远 葛瑛 陈健华
• 来源期刊: 协和医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 宏基因组二代测序 隐球菌 脑膜炎 脑脊液 诊断
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 605-611
• 页数: 7页
• 分类号: R515|R446.5
• 字数: 4030字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-9081.2019.06.010

摘要

目的 评价脑脊液宏基因组二代测序(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)技术在隐球菌脑膜炎诊断中的潜在应用价值.方法 回顾性收集北京协和医院2014年1月至2016年12月采用脑脊液mNGS技术辅助确诊的6例隐球菌脑膜炎患者临床资料,包括脑脊液常规、 生化、 细胞学、 培养、 墨汁染色等实验室检测结果,应用BGISEQ-100测序平台进行脑脊液病原测序,综合分析患者的临床、 实验室和辅助检查结果.结果 6例患者中,男性4例,女性2例,年龄26～53岁,中位年龄51岁.6例患者均无免疫缺陷性疾病,有头痛、 脑膜刺激症状及颅内压增高表现,5例患者出现发热,2例患者出现复视.脑脊液常规检查示白细胞和蛋白轻度升高,糖正常或轻度降低;5例患者脑脊液墨汁染色阳性,4例患者脑脊液隐球菌抗原检测阳性,2例患者脑脊液真菌培养阳性.脑脊液mNGS检测隐球菌核酸序数为108～25361,基因覆盖率0.19％～29.00％;5例提示新型隐球菌感染,其中3例经PCR检测证实为新型隐球菌感染;1例提示格特隐球菌感染,经生物质谱仪检测证实为格特隐球菌感染.结论 脑脊液mNGS技术可准确判断隐球菌感染,并对鉴别格特隐球菌具有一定优势,有助于降低免疫功能正常人群隐球菌脑膜炎的漏诊率.