水稻粒质量和粒形QTL定位及粒长位点qGL3.2的鉴定

• 作者: 刘世家 刘喜 刘子文 刘玲珑 朱泽 江玲 游佳 王致远 田云录 肖世卓 胡曼曼 谷晗 陈亮明
• 来源期刊: 南京农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 普通野生稻 染色体片段置换系 QTL 千粒质量 粒长 粒宽 长宽比
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 植物科学
• 页码范围: 612-621
• 页数: 10页
• 分类号: S511.032
• 字数: 8653字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7685/jnau.201812040

摘要

[目的]通过水稻粒质量和粒形相关基因的QTL分析,挖掘普通野生稻(Oryza rufipogon Griff.)中优异基因,为高产水稻资源的鉴定与品种改良提供研究基础和创新材料.[方法]以籼稻品种'9311'为受体亲本,普通野生稻为供体亲本构建的染色体片段置换系群体为研究材料,考察2015、2016和2017年水稻种子千粒质量、粒长、粒宽和长宽比等性状,利用QTL IciMapping 4.1软件对控制籽粒大小的QTL进行定位分析.并利用'9311'与小粒家系Q8衍生的次级F2群体验证第3染色体1个效应明显的QTL(qGL3.2).[结果]3年共定位到16个QTL,分布于第2、3、6、8和11染色体上,解释遗传变异的4.52％ ～13.08％.'9311'与Q8家系衍生的次级F2群体验证了标记Indel3-17和RM3646之间qGL3.2位点的真实性,其对千粒质量、粒宽和长宽比的贡献率分别为33.18％、8.76％和59.92％;对粒长的效应尤为明显,LOD值高达39.29,可解释表型变异的贡献率达61.43％.精细定位和测序分析表明qGL3.2在基因Os03g0407400编码区发生1个C-A的替换,导致蛋白翻译提前终止.对130份种质资源等位变异类型和籽粒长度的分析表明C-A等位变异与粒长高度相关.[结论]qGL3.2位点Os03g0407400基因C-A突变对水稻粒质量和粒形有重要影响,这为该基因的进一步育种利用和分子标记辅助选择提供依据.