gvpA-C间隔区在微囊藻株系分型中的应用

• 作者: 孔任秋 徐旭东 李小栋 王雅丽 高宏
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 微囊藻 gvpA-C间隔区序列 16SrDNA 分型
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 页码范围: 1098-1103
• 页数: 6页
• 分类号: Q344+.3
• 字数: 6320字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7541/2019.129

摘要

从暴发水华的水体分离微囊藻(Microcystis)株,并依据gvpA-C间隔区和16S rDNA序列对其分型和比较.在gvpA-C间隔区序列中,有的类型具有一段172—176 bp的额外序列.以不包括额外序列的0.27 kb序列相比较,不同类型之间差异碱基位点达50余个.在16S rDNA碱基变异集中的0.69 kb序列中,不同类型之间有差异的碱基位点共有8个.与16S rDNA序列相比,微囊藻gvpA-C间隔区序列具有高度变异性,并且其PCR扩增可一步完成,不受其他细菌污染,因而可用于微囊藻株系分型.由于横向转移,2种分型存在交叉关系.此外,原本含有或不含有额外序列的微囊藻gvpA-C间隔区序列在系统进化树中分别聚成一簇.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐旭东	中国科学院水生生物研究所	41	295	8.0	16.0
2	王雅丽	中国科学院水生生物研究所	19	66	6.0	7.0
3	孔任秋	中国科学院水生生物研究所	16	151	7.0	12.0
4	高宏	中国科学院水生生物研究所	22	153	5.0	12.0
5	李小栋	中国科学院水生生物研究所	1	0	0.0	0.0