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食管鳞癌中3个新miRNA的分子功能预测
食管鳞癌中3个新miRNA的分子功能预测
作者:
刘乃嘉
张庆英
李延鹏
王筠
盛司潼
钟姗
颜鸿飞
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
病理生理学
食管鳞癌
微小RNA
生物信息学
癌症相关通路
生物标记物
摘要:
为寻找食管鳞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)诊断与治疗的新分子标志物,利用实时定量荧光PCR技术检测ESCC中3个未知miRNAs(miR-3914、miR-8082和miR-4770)的表达状况;运用生物信息学方法分别对它们差异表达miRNA下游的候选靶基因做基因本体(gene ontology,GO)富集和KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)富集分析;采用蛋白免疫印迹方法观察转染miRNA mimic后一些与癌症发生和发展相关蛋白的表达改变.结果显示,与食管癌癌旁正常组织和正常食管上皮细胞比较,在ESCC组织/细胞中的miR-3914和miR-8082表达均呈显著性降低(P<0.05),但miR-4770无明显的表达变化.GO富集分析发现,miR-3914和miR-8082参与RNA聚合酶Ⅱ启动子转录、蛋白结合和细胞凋亡等生物学过程;KEGG富集分析发现,miR-3914和miR-8082两者均与癌症相关通路有关,且均可调控LAMC2、CCDC6和PDGFB基因.当ESCC细胞分别转染miR-3914 mimic和miR-8082 mimic后,与未转染组比较,p53蛋白质表达增加,而c-Myc和Bcl-2蛋白质表达降低.研究结果表明,miR-3914和miR-8082各自均具有成为辅助ESCC早期诊断与精准治疗生物靶标的潜能.
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文献信息
篇名
食管鳞癌中3个新miRNA的分子功能预测
来源期刊
深圳大学学报(理工版)
学科
医学
关键词
病理生理学
食管鳞癌
微小RNA
生物信息学
癌症相关通路
生物标记物
年,卷(期)
2019,(4)
所属期刊栏目
生物工程
研究方向
页码范围
347-353
页数
7页
分类号
R363.1+4|R735.1
字数
4222字
语种
中文
DOI
10.3724/SP.J.1249.2019.04347
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
张庆英
汕头大学医学院预防医学教研室
45
281
9.0
14.0
2
王筠
深圳大学生命与海洋科学学院
3
2
1.0
1.0
3
盛司潼
深圳大学生命与海洋科学学院
2
2
1.0
1.0
4
颜鸿飞
2
2
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5
钟姗
深圳大学生命与海洋科学学院
1
2
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9
刘乃嘉
深圳大学生命与海洋科学学院
1
2
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李延鹏
深圳大学生命与海洋科学学院
1
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传播情况
被引次数趋势
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引文网络
引文网络
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节点文献
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参考文献(0)
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二级引证文献(0)
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引证文献(2)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
病理生理学
食管鳞癌
微小RNA
生物信息学
癌症相关通路
生物标记物
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
深圳大学学报(理工版)
主办单位:
深圳大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-2618
CN:
44-1401/N
开本:
大16开
出版地:
深圳市南山区深圳大学行政楼419室
邮发代号:
46-206
创刊时间:
1984
语种:
chi
出版文献量(篇)
1946
总下载数(次)
10
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