林氏按蚊线粒体全基因组序列的测定及基于线粒体基因组的按蚊属系统发育分析

• 作者: 付文博 李廷景 毛启萌 闫振天 陈斌
• 来源期刊: 昆虫学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 蚊科 按蚊属 林氏按蚊 线粒体基因组 核苷酸组成 系统发育
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 进化与系统学
• 页码范围: 101-116
• 页数: 16页
• 分类号: Q969
• 语种: 中文
• DOI: 10.16380/j.kcxb.2019.01.011

摘要

[目的]对林氏按蚊Anopheles lindesayi完整的线粒体基因组进行测序及分析,依据已知的线粒体基因组构建并讨论按蚊属蚊虫的分子系统发育关系.[方法]对林氏按蚊线粒体基因组进行测序、注释,并对其基本特征和基本组成进行分析.基于串联的13个蛋白质编码基因的核苷酸序列和氨基酸序列,用ML法和贝叶斯法构建林氏按蚊和按蚊属其他32种蚊虫的系统发育树,据此探讨按蚊属蚊虫的系统发育关系和系统分类.[结果]林氏按蚊线粒体基因组全长为15 366 bp,包含13个蛋白质编码基因,22个tRNA基因,2个rRNA基因和一段控制区.林氏按蚊线粒体基因组呈现明显的AT偏斜和GC偏斜,AT偏斜为正,GC偏斜为负.除了COX1使用TCG和ND5使用GTG作为起始密码予以外,其他蛋白质编码基因的起始密码子均遵循ATN原则;终止密码子为TAA或者T.除了tRNASer(AGN)以外,其他的tRNA基因均呈现典型的三叶草二级结构.控制区AT含量最高,为94.54％.滑窗分析显示蛋白质编码基因是用于构建亚属或属水平系统发育关系的最佳分子标记.系统发育树强烈支持塞蚊亚属Cellia、按蚊亚属Anopheles、徕蚊亚属Nyssorhynchus和柯特蚊亚属Kerteszia均为单系群.小五斑按蚊An.atroparvus和四斑按蚊An.quadrimaculatus A这两个种聚到一起,从传统的形态分类上讲,它们和林氏按蚊均属于按蚊亚属按蚊系蚊虫.但本研究构建的4个系统发育树均显示,(小五斑按蚊An.atroparvus+四斑按蚊An.quadrimaculatusA)和林氏按蚊被属于迈蚊系的中华按蚊分开,这为两个系的分类提供了新的论点.[结论]本研究获得了林氏按蚊的完整的线粒体基因组,探析了按蚊属的线粒体基因组特征和系统发育关系,为进一步研究蚊科线粒体基因组和系统发育关系提供了依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈斌	重庆师范大学昆虫与分子生物学研究所重庆市媒介昆虫重点实验室	73	290	9.0	15.0
2	闫振天	重庆师范大学昆虫与分子生物学研究所重庆市媒介昆虫重点实验室	14	29	3.0	5.0
3	付文博	重庆师范大学昆虫与分子生物学研究所重庆市媒介昆虫重点实验室	11	26	3.0	5.0
4	李廷景	重庆师范大学昆虫与分子生物学研究所重庆市媒介昆虫重点实验室	11	17	3.0	4.0
5	毛启萌	重庆师范大学昆虫与分子生物学研究所重庆市媒介昆虫重点实验室	1	0	0.0	0.0