向日葵锈菌弹性金属蛋白酶基因克隆及生物信息学分析

• 作者: 宋阳 景岚 李鑫淳 路妍
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 向日葵锈菌 弹性金属蛋白酶 克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 资源环境·植物保护
• 页码范围: 186-193
• 页数: 8页
• 分类号: Q78|S432.01
• 字数: 6200字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.201751261

摘要

为了研究向日葵锈病的致病机制,将向日葵锈菌转录组中表达量较高的一个基因(KU994904)中成熟部分进行生物信息学分析及基因克隆.利用Interpro对蛋白ORF区域进行分析,确定其成熟区域,通过生物信息学相关软件对其进行结构预测及预测分析,从向日葵锈菌中提取总RNA,并利用RT-PCR方法扩增此蛋白酶成熟基因并克隆.结果显示:该蛋白酶成熟基因序列全长1335 bp,编码445个氨基酸,分子质量49.5 ku,其与M36家族中5条序列具有较高相似性,并发现同胞外金属蛋白酶基因序列相似度达到53.77％.因此,推断其为弹性金属蛋白酶.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	路妍	内蒙古农业大学农学院	5	10	1.0	3.0
2	景岚	内蒙古农业大学农学院	52	289	9.0	13.0
3	宋阳	内蒙古农业大学农学院	33	239	8.0	14.0
4	李鑫淳	内蒙古农业大学农学院	2	2	1.0	1.0