利用mtDNA D-loop区研究贵州猪种的遗传多样性与起源

• 作者: 卜小雁 周迪 师新彩 易恒洁 李兴才 李辉 杨华婷 赵忠海 陈林 龙清孟
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪 线粒体DNA D-loop区 遗传变异 核苷酸多样性
• 年，卷（期）: 2019,（7）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 1206-1214
• 页数: 9页
• 分类号: S828
• 字数: 4929字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2019.07.008

摘要

线粒体DNA (mitochondrial DNA,mtDNA)作为核外遗传物质,承载着重要的遗传信息,其D-loop区序列能反应出物种的遗传多样性.为了对贵州猪(Sus scrofa domesticus)种的遗传多样性进行评估,本研究选取了高坡猪、关岭猪、从江香猪、黔南黑猪、黔北黑猪、柯乐猪、江口萝卜猪、宗地花猪、白洗猪和糯谷猪共10个贵州省地方猪种与梅山猪、荣昌猪和大白猪3个外地品种作为研究对象,利用PCR扩增技术结合直接测序的方法对mtDNA的D-loop区全序列进行扩增分析.结果 显示,实验群体的mtDNA D-loop区全序列为1 117～1 148 bp,共12种长度的序列,除了宗地花猪的碱基组成差异较大,其他品种的碱基含量基本无差异,均表现为T的含量最高,C的含量最低,碱基A+T含量明显高于C+G;在有效测序结果的149条拼接序列中发现66个多态位点,定义了16种单倍型,单倍型多样性为0.421 5.分析高坡猪群体与其他猪种群体之间遗传关系,发现其间基因交流较少,基因交流值(Nm)均小于1;高坡猪与宗地花猪之间的遗传分化指数最高,遗传分化指数(Fst)值为0.412 78,高坡猪与黔南黑猪和关岭猪的遗传分化指数较低,说明三者之间的遗传关系较近.进行品种间的遗传多样性分析时发现,高坡猪与黔北黑猪亲缘关系较近,而宗地花猪与其他12个品种的亲缘关系都较远.综合本研究结果可推测,目前10个贵州地方猪种的遗传多样性受到外来品种的影响.本研究为进一步了解贵州猪种起源分化以及遗传多样性提供理论支持,并为地方猪种保护提供参考资料.