大豆GmGW2基因的生物信息学分析

• 作者: 丁晨 刘灿 吕金东 屈亦潇 杨翊晖 郭蓓 陈汉谋
• 来源期刊: 大豆科学
• 关键词: 大豆 中黄10号 GmGW2 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 379-384
• 页数: 6页
• 语种: 中文
• DOI: 10.11861/j.issn.1000-9841.2019.03.0379

摘要

GW2基因在多种植物中发挥调控籽粒性状的功能,为预测分析大豆中GW2基因的功能,前期通过同源克隆的方法从大豆中成功克隆出GmGW2基因的cDNA序列.为了继续开展深入研究,本试验从大豆中黄10号中克隆出GmGW2基因的全长DNA序列并进行了较为详细的生物信息学分析.结果 表明:GmGW2全长8 467 bp,包含8个外显子和7个内含子,编码431个氨基酸.预测是一个不稳定亲水蛋白,定位于细胞核或细胞质中,不含跨膜结构域及信号肽,具有Zinc finger和RING-type结构域.二级、三级结构预测分析显示,α-螺旋及不规则卷曲是其整体蛋白质结构中的主要组成结构元件.利用该基因的DNA序列,构建进化树分析得出该基因与木豆、相思子、鹰嘴豆亲缘关系较近.根据以上分析结果推测GmGW2基因可能也具有调控大豆籽粒发育的功能.此研究旨在为进一步挖掘和验证GmGW2基因功能奠定基础,为大豆产量育种工作提供有益信息.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘灿	北京农学院生物科学与工程学院	5	22	2.0	4.0
2	吕金东	北京农学院植物科学技术学院	2	0	0.0	0.0
3	郭蓓	北京农学院生物科学与工程学院	34	242	7.0	15.0
7	屈亦潇	北京农学院生物科学与工程学院	1	0	0.0	0.0
8	陈汉谋	北京农学院生物科学与工程学院	1	0	0.0	0.0
9	杨翊晖	北京农学院生物科学与工程学院	2	0	0.0	0.0
10	丁晨	北京农学院生物科学与工程学院	2	0	0.0	0.0