大豆NRT1.2同源基因的生物信息学分析

• 作者: 左妍妍 曹金山 朱林 杨薇 王小迪 王幼宁
• 来源期刊: 大豆科学
• 关键词: 大豆 氮素营养 NRT1.2 共生固氮 生物信息学
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 371-378
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.11861/j.issn.1000-9841.2019.03.0371

摘要

AtNRT1.2已被证明在模式植物拟南芥中作为低亲和硝酸根转运蛋白参与硝态氮的吸收.为研究其编码基因在大豆中的同源基因,进一步挖掘大豆中参与调控共生固氮的候选基因并为开展其功能研究奠定基础,本研究利用Phytozome、ProtParam、TAIR和SoyBase数据库以及GSDS、TMpred Server、ClustalX 2.1和MEGA 7.0软件,对NRT1.2在大豆中的6个同源蛋白的系统进化关系、基因序列、氨基酸序列、跨膜结构以及表达模式进行生物信息学分析.系统进化分析发现GmNRT1.2a、G mNRT1.2b、GmNRT1.2c和GmNRT1.2d与菜豆和苜蓿等豆科植物的NRT1.2亲缘关系较近.氨基酸序列比对分析发现GmNRT1.2a和GmNRT1.2b相似度较高,且GmNRT1.2s都含有类似的跨膜结构.在表达模式方面,SoyBase的数据显示GmNRT1.2s同源基因的表达存在较明显差别,GmNRT1.2a和GmNRT1.2b在大豆根及根瘤中表达较高.以上生物信息学分析结果暗示GmNRT1.2s可能在参与硝酸盐吸收的同时也介导大豆共生固氮过程.本研究结果为深入探究GmNRT1.2s在氮吸收与共生固氮协同调控大豆氮素供给的分子机制方面提供了一定的数据支持.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	曹金山	华中农业大学植物科学技术学院	3	2	1.0	1.0
2	王幼宁	华中农业大学植物科学技术学院	3	2	1.0	1.0
3	朱林	华中农业大学植物科学技术学院	3	3	1.0	1.0
4	左妍妍	华中农业大学植物科学技术学院	1	2	1.0	1.0
5	王小迪	华中农业大学植物科学技术学院	1	2	1.0	1.0
6	杨薇	华中农业大学植物科学技术学院	1	2	1.0	1.0