广西那坡县发现乙肝病毒新基因亚型D11

• 作者: 任创创 何翔 刘华兵 方钟燎 杨庆利 王学燕 胡莉萍 贾蕙华 陈钦艳
• 来源期刊: 应用预防医学
• 学科: 医学
• 关键词: 乙型肝炎病毒 系统进化分析 亚型D11
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 88-94,98
• 页数: 8页
• 分类号: R512.6+2
• 字数: 4315字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-758X.2019.02.002

摘要

目的 2011年,在广西那坡县发现一例HBsAg阳性携带者,其所携带的HBV利用S基因序列分型法无法分型,本研究意在用全基因组分型法对其进行分型.方法 为便于前后对比,除201 1年血清标本外,还收集该携带者2018年的血清标本.检测前后2份标本HBV血清标志物和病毒载量,使用酚氯仿法提取HBV DNA,巢式PCR扩增HBV全基因组,将扩增产物进行克隆并测序.利用软件Mega 6.0、Bioedit 7.0对测序结果进行分析.结果 2011年和2018年的2份标本HBsAg均为阳性,2份标本的PCR产物分别获得15个克隆株.对获得的克隆株进行生物信息学分析发现,2011年该携带者体内乙肝病毒基因型为B型、D型以及未知基因型;2018年该携带者体内乙肝病毒基因型仅为D型.30个克隆株中有23个单独聚集成簇,bootstrap值为100％,与D1-D10亚型间核苷酸的差异＞4％.结论 该携带者体内的HBV基因型为新基因亚型D11.