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TRPS1在胃癌中的表达及生物信息学分析
TRPS1在胃癌中的表达及生物信息学分析
作者:
吕自力
吴红
黄梦岚
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
TRPS1
胃癌
Meta分析
生物信息学分析
信号通路
摘要:
目的 探究转录抑制因子GA T A结合基因1(TRPS1)在胃癌中的表达水平及其与表达相关基因的细胞功能及信号通路.方法 通过筛选基因表达谱数据动态分析(GEPIA)、基因芯片表达谱公共数据库(GEO)数据,对TRPS1在胃癌组织中的数据进行Meta分析.采用实时荧光定量PCR技术(RT-qPCR)检测TRPS1在胃癌细胞中的表达水平.应用生物信息学分析T RPS1及表达相似基因的细胞功能和信号通路.结果 在公共数据库中,T RPS1在胃癌组织中均呈高表达,合并标准均差SM D为0.40(95%CI:0.04~0.76,P=0.028),敏感性分析稳定,无发表偏倚.TRPS1在胃癌细胞HGC-27和M GC-803中呈高表达(均P<0.01).TRPS1和表达相关基因ESR1富集在多条功能通路中,与转录因子活性 、序列特异性DNA结合等肿瘤相关通路密切相关;TRPS1与ESR1存在直接蛋白互作关联.结论 TRPS1在胃癌中可能是一个促癌因子,在胃癌的调控机制中有重要作用.
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文献信息
篇名
TRPS1在胃癌中的表达及生物信息学分析
来源期刊
蛇志
学科
医学
关键词
TRPS1
胃癌
Meta分析
生物信息学分析
信号通路
年,卷(期)
2019,(2)
所属期刊栏目
基础研究
研究方向
页码范围
188-192,201
页数
6页
分类号
R365
字数
3760字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1001-5639.2019.02.006
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
吕自力
广西医科大学第一附属医院病理科
49
132
7.0
9.0
2
黄梦岚
广西医科大学第一附属医院病理科
3
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3
吴红
广西医科大学第一附属医院病理科
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胃癌
Meta分析
生物信息学分析
信号通路
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
蛇志
主办单位:
中国蛇协
出版周期:
季刊
ISSN:
1001-5639
CN:
45-1168/R
开本:
大16开
出版地:
广西南宁市长福路6号
邮发代号:
48-52
创刊时间:
1989
语种:
chi
出版文献量(篇)
4878
总下载数(次)
1
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