中国近海区域古菌群落结构研究概述

• 作者: 刘吉文 刘晓月 刘骥 孟哲 张晓华 朱尚清 王雅文 郑艳芬
• 来源期刊: 海洋科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 中国近海 海洋古菌 群落结构 分子生物学技术
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 研究综述
• 页码范围: 123-134
• 页数: 12页
• 分类号: Q938
• 字数: 10086字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11759/hykx20190220001

摘要

古菌作为海洋微生物的重要组成部分,是海洋生态系统中物质与能量传递的重要贡献者,在全球生物地球化学循环中扮演着不可或缺的角色.虽然目前绝大多数的古菌尚未获得纯培养,但近年来分子生物学技术的发展使人们认识到古菌参与甚至主导了海洋生源要素循环的关键过程.本文介绍了目前研究海洋古菌多样性的主要手段,包括:荧光定量PCR、16S rRNA基因扩增子高通量测序、宏组学以及单细胞测序等技术,系统地阐述了中国近海不同区域(包括辽河口、黄河口、渤海、南北黄海、长江口、东海北部、珠江口以及南海区域)海水及沉积物中的古菌群落结构和多样性特征.研究表明我国近海地区的主要古菌类群为广古菌门(Euryarchaeota)、奇古菌门(Thaumarchaeota)、乌斯古菌门(Woesearchaeota)和深古菌门(Bathyarchaeota)等,其生物地理学分布主要受到环境因子和距离因素的影响,且在河口和近海海域呈现出完全不同的分布特点.在此基础上,对未来的研究方向进行展望,为全面深入了解我国边缘海生态系统中古菌群落及其参与的生物地球化学循环奠定了基础.