SXT/R391元件核心基因的生物信息学分析

• 作者: 任洪广 周江林 周静 孔娜 岳俊杰 张琪 彭小川 李北平 梁龙 胡明达 靳远
• 来源期刊: 生物技术通讯
• 学科: 生物学
• 关键词: SXT/R391元件 重组分析 正选择分析
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 597-603
• 页数: 7页
• 分类号: Q811.4
• 字数: 4496字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-0002.2019.05.002

摘要

目的:SXT/R391元件是革兰阴性菌中研究最充分、已知成员最多的整合性接合元件家族,本研究的主要目的是探讨SXT/R391元件核心基因组的适应性进化规律.方法:收集数据库中及文献报道的SXT/R391家族元件数据,并利用已测序的细菌基因组序列预测该家族元件,分析元件核心基因的进化特性.结果:通过文献搜集和预测,共获得83个SXT/R391元件的基因组序列.在52个核心基因中,计算发现22个基因在进化过程中经历了重组,基因分布于SXT/R391元件的4个必需模块.此外,在7个基因中检测到了正选择信号.结论:分析了SXT/R391元件核心基因的进化机制,为了解该家族的进化和扩散奠定了基础.