一种新型抗菌肽基因决定簇的克隆与序列结构特征

• 作者: 于宏伟 刘洋 柯晓静 郭润芳
• 来源期刊: 河北农业大学学报
• 关键词: 非核糖体肽合成酶 交错式热不对称 克隆 结构特征
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 页码范围: 65-70
• 页数: 6页
• 分类号: Q933
• 语种: 中文
• DOI: 10.13320/j.cnki.jauh.2019.0011

摘要

侧孢短芽孢杆菌(Brevibacillus laterosporus)S62-9菌株产生的抗菌肽BBL属于非核糖体合成肽,其生物合成涉及到一系列相关基因.为了获得完整的抗菌肽BBL基因决定簇,本研究基于部分已知的NRPS-A结构域基因序列,以S62-9菌株质粒DNA为模板,采用TAIL-PCR技术对NRPS-A结构域的上游进行扩增,得到一个大小为2.74 kb的序列,该序列包含NRPS-A的5’末端序列、pp-binding序列以及1个ABC转运蛋白基因.该序列进一步与已知序列进行序列拼接及软件分析比对,最终获得一个大小为22.2 kb的基因簇,该基因簇包含13个Bbl功能结构域,根据功能该基因簇分为3类功能相关基因:一类是编码转运相关蛋白,BblE包含3个ABC转运蛋白,负责抗菌肽向胞外渗透运输;二是催化短肽合成基因,Bbl F包含了pp-binding结构域和NRPS-A结构域,与氨基酸的装载和缩合有关,负责短肽的合成;三是肽链修饰相关基因,Bbl D、Bbl E、Bbl M、BblK等基因负责肽的修饰.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	于宏伟	河北农业大学食品科技学院	73	542	13.0	20.0
2	郭润芳	河北农业大学食品科技学院	57	836	11.0	28.0
3	柯晓静	河北农业大学食品科技学院	23	64	5.0	6.0
4	刘洋	河北农业大学食品科技学院	33	139	6.0	8.0