不同地理种群鳄蜥tlr4基因遗传多样性及SNPs分布特点分析

• 作者: 武正军 江海英 莫大颖 陈金平 黄铭威
• 来源期刊: 动物学杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: Toll样受体4 遗传多样性 点突变 鳄蜥
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 845-859
• 页数: 15页
• 分类号: Q953
• 语种: 中文
• DOI: 10.13859/j.cjz.201906011

摘要

Toll样受体(TLRs)是一类识别病原体中高度保守的病原相关分子模式(PAMPs)的蛋白家族,在启动先天性免疫中具有重要作用.人类toll样受体4基因(toll4)的点突变与许多疾病有关,如呼吸道合胞病毒感染、动脉粥样硬化、疟疾等,并且这种点突变往往具有种族分布特异性.鳄蜥(Shinisaurus crocodilurus)是一种古老的爬行动物,属于国家Ⅰ级保护野生动物,由于其遭受非法捕杀、栖息地破坏等人为干扰,目前数量极其稀少.近年来,鳄蜥因疾病造成大量的死亡,且这种疾病的分布具有种群差异性,不同种群往往疾病症状也不同,可能是因不同的病原体感染引起的.我们设想toll4基因的点突变在鳄蜥种群之间可能具有分布的差异性,以适应不同的当地病原体.因此,本文利用PCR产物直接测序和生物信息学分析法初步探索鳄蜥toll4基因的遗传多样性以及单核苷酸多态性(SNPs)的分布特点,验证该基因的点突变是否具有种群特异性分布特点,以及预测其氨基酸替换是否对蛋白质结构和功能产生影响.结果 获得的扩增片段长为1 694 bp,在5个种群52条序列中(登录号MN380726～MN380777),共发现27个突变位点,导致9个氨基酸替换,其中3个氨基酸替换被预测为影响蛋白质的结构和功能.27个点突变中有12个只分布在单个种群,4个分布无种群特异性,即每个种群中均有野生型和突变型,其余1 1个点突变的突变型分布在2或3个种群不等.研究表明,鳄蜥toll4基因遗传多态性在各种群间不一致,且点突变具有种群特异性分布特征,反映不同地理种群遭受不同的病原压力.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	武正军		3	13	1.0	3.0
3	莫大颖		1	0	0.0	0.0
12	江海英		1	0	0.0	0.0
13	黄铭威		1	0	0.0	0.0
16	陈金平		1	0	0.0	0.0