通过二代测序技术开发25个小熊猫的微卫星位点

• 作者: 侯蓉 张亮 张志和 张文平 杨艾琳 沈富军 谢军金
• 来源期刊: 四川动物
• 学科: 医学
• 关键词: 小熊猫 微卫星位点 种群分析
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 基础资料
• 页码范围: 56-61
• 页数: 6页
• 分类号: Q959.838|R318.04
• 字数: 3071字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11984/j.issn.1000-7083.20180182

摘要

采用Roche 454基因组测序平台在小熊猫Ailurus fulgens的基因组中进行测序拼装,得到了大量含有微卫星片段的序列.本文选择了其中467条序列设计引物,筛选出了115个微卫星位点,最终选出25个微卫星位点,重复单元包含TAT、GATA、AAACA、AAAACA等,并应用到42只小熊猫个体上进行了分型.观察到的等位基因数为3 ～ 10;观察杂合度和期望杂合度分别为0.143 ～ 0.929和0.136 ～0.869;多态信息含量为0.128 ～0.843,经检测所有位点均未偏离哈迪-温伯格平衡.这些微卫星位点可应用于小熊猫圈养种群的遗传管理,在未来还可进一步作为小熊猫的种群遗传学等研究的有力工具.