类风湿关节炎滑膜巨噬细胞基因芯片分析

• 作者: 徐海栋 武振方 王宇翔 童也
• 来源期刊: 江苏大学学报（医学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 类风湿关节炎 巨噬细胞 生物信息学 GEO数据库 基因芯片
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 基础医学
• 页码范围: 379-385
• 页数: 7页
• 分类号: R593.22
• 字数: 2820字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13312/j.issn.1671-7783.y190106

摘要

目的:寻找并分析类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)的关键基因,从而更好地理解RA的潜在发病机制.方法:采用表达谱的综合分析方法鉴定RA滑膜液巨噬细胞中差异表达基因(differential expression genes,DEGs).利用功能注释、蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络构建以及寻找核心基因,探讨DEGs在RA中的潜在生物学作用.在GSE17755数据集中对鉴定的DEGs在RA外周血中的mRNA表达水平进行验证.结果:与对照组相比,RA患者滑膜液巨噬细胞中共找出489个DEGs,其中上调基因359个,下调基因130个.DEGs在炎症反应调节、趋化因子受体结合、肿瘤坏死因子信号通路等方面均有较显著的富集.STAT1、CXCL10、FPR2、ITGAM、PPBP、IRF7、CCL5、OASL、OAS3、IRF1是DEGs的PPI网络中的核心基因.在GSE17755数据集中检测除FPR2之外的9个核心基因的mRNA表达情况,结果表明,与正常人相比,RA患者外周血细胞中STAT1、PPBP、OASL的表达水平明显上调,ITGAM、IRF7、CCL5、IRF1有下调的趋势.结论:STAT1与OASL等基因在RA疾病中可能发挥重要作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王宇翔	东部战区总医院骨科	3	1	1.0	1.0
2	徐海栋	东部战区总医院骨科	4	1	1.0	1.0
3	童也		5	1	1.0	1.0
4	武振方	东部战区总医院骨科	1	1	1.0	1.0