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草莓FvARF5基因的克隆、生物信息学及表达分析
草莓FvARF5基因的克隆、生物信息学及表达分析
作者:
苏丽艳
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
草莓
FvARF5
生长素
基因克隆
摘要:
生长素响应因子ARF是一类新的转录因子,通过激活或抑制生长素响应基因的表达调控植物的生长发育过程.为解析草莓生长素响应因子FvARF5在草莓形成过程中的功能,以草莓为试验材料,克隆了FvARF5基因并进行了生物信息学分析,利用qPCR分析了FvARF5在草莓不同组织及植物激素处理下的表达模式.结果表明,FvARF5基因开放阅读框为2745 bp,编码914个氨基酸,蛋白质分子质量为100.65 ku,等电点为5.25.多序列比对和系统进化树分析表明,FvARF5基因具有保守的B3 DNA结合结构域和生长素响应因子保守结构域,与蔷薇科月季ARF5基因的进化关系最近,相似度达95%.亚细胞定位预测分析表明,FvARF5蛋白定位于细胞核中.启动子分析显示,FvARF5基因具有多样化的激素应答元件.qPCR结果表明,FvARF5存在组织表达差异,在茎和绿果中表达量较高.另外,FvARF5基因表达受到生长素和赤霉素的诱导,初步推测该基因可能参与了生长素和赤霉素调控草莓果实的形成过程.为进一步研究FvARF5基因的功能奠定基础.
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文献信息
篇名
草莓FvARF5基因的克隆、生物信息学及表达分析
来源期刊
华北农学报
学科
农学
关键词
草莓
FvARF5
生长素
基因克隆
年,卷(期)
2019,(3)
所属期刊栏目
作物遗传育种·种质资源·生物技术
研究方向
页码范围
16-22
页数
7页
分类号
Q78|S661.1
字数
4661字
语种
中文
DOI
10.7668/hbnxb.201751324
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
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被引次数
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G指数
1
苏丽艳
西安文理学院生物与环境工程学院秦岭野生观赏植物研究中心
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华北农学报
主办单位:
河北
北京
天津
山西
河南
内蒙古六省市农科院农学会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-7091
CN:
13-1101/S
开本:
大16开
出版地:
石家庄市和平西路598号
邮发代号:
18-10
创刊时间:
1986
语种:
chi
出版文献量(篇)
6276
总下载数(次)
4
总被引数(次)
88357
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