NaCl胁迫下红砂种子萌动期差异表达基因的转录组分析

• 作者: 刘晓威 刘肖艳 张华新 朱建峰 杨秀艳 武海雯
• 来源期刊: 南京林业大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 红砂 NaCl胁迫 种子萌发 差异表达基因 转录组分析
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 28-36
• 页数: 9页
• 分类号: Q943.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2006.201811020

摘要

[目的]筛选NaCl胁迫下红砂萌发期的差异表达基因,为耐盐碱树种选育提供基因资源.[方法]以前期拟合的萌发阈值浓度(273 mmol/L,记为M)、最适萌发浓度(43 mmol/L,记为L)、蒸馏水(记为C)处理红砂种子,每个处理3次重复,待胚根突破种皮,不超过2 mm时取出,进行转录组测序.[结果]分别在L与C对比组(记为LvsC)、M与C对比组(记为MvsC)、M与L对比组(记为MvsL)中筛选出210、2273、2888个差异表达基因,其中LvsC中116个上调表达,94个下调表达;MvsC中1781个上调表达,492个下调表达;MvsL中2165个上调表达,723个下调表达;上调表达基因在KEGG富集中主要集中在核糖体、碳代谢、细胞色素P450代谢、谷胱甘肽代谢等途径,下调表达基因主要富集在蔗糖淀粉代谢、内质网蛋白质加工等过程.[结论]盐胁迫条件下,差异基因诱导相关反应协同发挥作用,最终使胚轴细胞伸长,突破种皮完成萌发.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张华新		33	573	12.0	23.0
2	杨秀艳		25	424	10.0	20.0
3	朱建峰		11	80	4.0	8.0
4	武海雯		13	105	5.0	10.0
5	刘晓威		5	12	3.0	3.0
6	刘肖艳	河南农业大学生命科学学院	1	3	1.0	1.0