猪转录因子SOX2下游调控蛋白筛选及调控网络建立

• 作者: 伟人悦 刘忠华 吕嘉伟 尹智 李妍 王加强 赵剑超
• 来源期刊: 东北农业大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 猪SOX2基因 转录因子 下游调控蛋白 调控网络 基因敲除
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 44-57
• 页数: 14页
• 分类号: Q291
• 字数: 6445字
• 语种: 中文

摘要

SOX2是早期胚胎发育与干细胞多能性维持相关的重要转录因子.从猪孤雌囊胚中克隆获得猪SOX2基因并构建对应过表达体系.通过猪pEF细胞系与PK15细胞系中过表达SOX2基因及qPCR技术,检测89个下游调控候选基因表达情况,建立猪SOX2下游调控网络.结果发现,GATA4、MSC、GSC、FGF4、STELLA、ACACA、FN1、KLF4以及MEK基因在pEF细胞系与PK15细胞系间呈差异性调控表达.BMP4、FGFR2、ACAA2、ACSL3、β-CATENIN、c-MYC、MYST3、GSK3β、ALDH3A2、STAT3、SMAD2、KDM6A、ACADL、PI3K与WDR3基因在两种细胞系中呈同趋势性调控表达;经JASPAR数据库预测发现,WDR3、β-CATENIN、ACAA2、KDM6A、STAT3、ACADL、GSK3β与ALDH3A2基因启动子区域存在高相关性的SOX2蛋白结合位点,推测这些基因受SOX2蛋白直接调控;同时构建针对猪SOX2基因的高效敲除体系.研究结果为建立物种特异性的猪SOX2调控网络提供数据基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘忠华	东北农业大学生命科学学院	66	257	8.0	13.0
2	尹智	东北农业大学生命科学学院	9	61	4.0	7.0
3	王加强	东北农业大学生命科学学院	5	5	2.0	2.0
4	李妍	东北农业大学生命科学学院	21	131	4.0	11.0
5	赵剑超	东北农业大学生命科学学院	3	0	0.0	0.0
6	吕嘉伟	东北农业大学生命科学学院	3	3	1.0	1.0
7	伟人悦	东北农业大学生命科学学院	4	0	0.0	0.0