基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取       
摘要:
桃(Prunus persica)是我国重要的果树树种之一,其果皮色泽是重要的外观品质.本研究以同期成熟的红色桃‘秋雪’和白里‘肥桃’为试材,基于Illumina HiSeqTM 2500高通量测序平台,采用RNA-seq技术比较分析两个品种桃果实不同发育时期转录组数据.测序共产生16.59 Gb Clean Data测序数据,基于有参或无参转录组序列组装法获得30 211个Unigene,其中3 060个差异表达基因在Nr、Swissprot、GO、COG和KEGG数据库中得到功能注释.在这些注释的差异基因当中有6个KEGG通路得到显著富集,其中包括类黄酮合成通路和光合通路.差异基因与植物转录因子数据库比对,筛选到153个差异表达基因分属于32个转录因子家族,其中包括已报道的参与调控花青苷合成的MYB和bHLH两类转录因子家族.进一步对花青苷代谢途径中的类黄酮合成通路中的关键酶基因进行q-PCR分析发现,CHS、CHI和F3H在‘肥桃’和‘秋雪’桃中表达方式很相似,但DFR、ANS和UFGT表达模式上存在较大差别,尤其是UFG倦因.通过果皮花青苷含量检测分析发现,‘秋雪’桃与‘肥桃’果皮中花青苷含量变化趋势与UFGT基因的表达模式一致.本研究结果有助于阐明桃不同果皮色泽分子遗传差异,为揭示其调控机制奠定基础.
推荐文章
外源腐胺促进苹果果皮花青苷积累的效应
花青苷
红富士苹果
腐胺
实时荧光定最PCR
转录水平
基于转录组分析筛选牛心朴子响应低温胁迫的转录因子家族
牛心朴子
转录组
转录因子
低温胁迫
差异表达基因
套袋对苹果果皮花青苷合成及着色的影响
苹果
套袋
花青苷
着色
苯丙烷类代谢
内容分析
关键词云
关键词热度
相关文献总数  
(/次)
(/年)
文献信息
篇名 基于转录组分析不同着色桃果皮花青苷表达模式与转录因子
来源期刊 植物生理学报 学科
关键词 桃 转录组 转录因子 果皮色泽 花青苷
年,卷(期) 2019,(3) 所属期刊栏目 研究报告
研究方向 页码范围 310-318
页数 9页 分类号
字数 语种 中文
DOI 10.13592/j.cnki.ppj.2018.0311
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 李林光 142 574 12.0 17.0
2 王海波 61 234 8.0 12.0
3 何平 43 120 6.0 8.0
4 常源升 27 82 6.0 8.0
传播情况
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献  (138)
共引文献  (155)
参考文献  (33)
节点文献
引证文献  (0)
同被引文献  (0)
二级引证文献  (0)
1958(1)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(1)
1987(1)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(1)
1989(2)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(2)
1991(2)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(2)
1992(2)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(2)
1993(1)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(1)
1994(5)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(4)
1995(3)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(3)
1996(5)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(5)
1997(2)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(2)
1998(4)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(4)
1999(6)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(6)
2000(6)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(6)
2001(10)
  • 参考文献(3)
  • 二级参考文献(7)
2002(7)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(6)
2003(10)
  • 参考文献(3)
  • 二级参考文献(7)
2004(5)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(5)
2005(9)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(8)
2006(14)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(14)
2007(11)
  • 参考文献(2)
  • 二级参考文献(9)
2008(9)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(9)
2009(9)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(8)
2010(12)
  • 参考文献(4)
  • 二级参考文献(8)
2011(7)
  • 参考文献(2)
  • 二级参考文献(5)
2012(11)
  • 参考文献(4)
  • 二级参考文献(7)
2013(10)
  • 参考文献(4)
  • 二级参考文献(6)
2014(3)
  • 参考文献(3)
  • 二级参考文献(0)
2015(3)
  • 参考文献(3)
  • 二级参考文献(0)
2017(1)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(0)
2019(0)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(0)
  • 引证文献(0)
  • 二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
桃
转录组
转录因子
果皮色泽
花青苷
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
植物生理学报
月刊
2095-1108
31-2055/Q
大16开
上海市岳阳路319号31B楼
4-267
1951
chi
出版文献量(篇)
5646
总下载数(次)
4
论文1v1指导