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沙蒿AQP基因结构预测及干旱胁迫下的时空表达模式研究
沙蒿AQP基因结构预测及干旱胁迫下的时空表达模式研究
作者:
张丹
张莉
王超
胡晓莹
马海龙
马玉花
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
沙蒿
水道通蛋白
结构预测
干旱胁迫
表达模式
摘要:
为探究水通道蛋白(AQP)在沙蒿响应干旱胁迫中的作用机制,该研究以青海省柴达木盆地沙蒿为试验材料,采用RACE技术对其AQP基因进行扩增,获得沙蒿AQP全长克隆并对AQP蛋白进行结构预测和分析;采用qRT-PCR对沙蒿AQP基因在不同程度干旱胁迫以及不同组织部位的表达模式进行分析.结果 表明:(1)成功克隆获得沙蒿AQP基因长746 bp的片段1和长534 bp的片段2,经拼接后得到全长cDNA序列,沙蒿AQP基因总长为864 bp.(2)亚细胞定位表明沙蒿AQP基因定位于细胞膜上;同源比对显示沙蒿与向日葵、莴苣、橡胶树等植物的AQP基因具有较高的相似性;结构预测表明AQP蛋白含6个跨膜螺旋结构且亲水性较弱,α螺旋和无规则卷曲为AQP蛋白二级结构的主要构成元件.(3) qRT-PCR分析表明,沙蒿AQP基因随着干旱胁迫的加重呈现有规律的变化,根、茎、叶中表达均上调,且叶中AQP基因表达量上调幅度最大.研究表明沙蒿AQP基因结构特征及其表达模式都是沙蒿对干旱胁迫的一种适应.
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甘蔗
ATP结合蛋白
基因克隆
生物信息学
干旱胁迫
表达特性
内容分析
文献信息
引文网络
相关学者/机构
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期刊文献
内容分析
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关键词热度
相关文献总数
(/次)
(/年)
文献信息
篇名
沙蒿AQP基因结构预测及干旱胁迫下的时空表达模式研究
来源期刊
西北植物学报
学科
生物学
关键词
沙蒿
水道通蛋白
结构预测
干旱胁迫
表达模式
年,卷(期)
2019,(9)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
1543-1550
页数
8页
分类号
Q785|Q786
字数
6980字
语种
中文
DOI
10.7606/j.issn.1000-4025.2019.09.1543
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
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G指数
1
马玉花
青海大学农牧学院
40
131
7.0
9.0
2
张莉
青海大学农牧学院
33
86
5.0
7.0
3
张丹
青海大学农牧学院
4
10
2.0
3.0
4
王超
青海大学农牧学院
2
0
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胡晓莹
青海大学农牧学院
1
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马海龙
青海大学农牧学院
1
0
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引文网络
引文网络
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共引文献
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(24)
节点文献
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同被引文献
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节点文献
沙蒿
水道通蛋白
结构预测
干旱胁迫
表达模式
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
西北植物学报
主办单位:
西北农林科技大学
陕西省植物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-4025
CN:
61-1091/Q
开本:
大16开
出版地:
陕西省杨陵邰城路3号西北农林科技大学
邮发代号:
52-73
创刊时间:
1980
语种:
chi
出版文献量(篇)
7739
总下载数(次)
9
总被引数(次)
145271
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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