基于转录组测序筛选鼠伤寒沙门菌hfq基因缺失菌的差异表达基因

• 作者: 刘丽娟 周碧君 文明 李晨 杨琦 杨阳 潘永 王开功 董然然
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 沙门菌 沙门菌hfq基因缺失株 sRNA伴侣蛋白Hfq
• 年，卷（期）: 2019,（12）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 2578-2585
• 页数: 8页
• 分类号: S
• 字数: 4262字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2019.12.023

摘要

旨在鼠伤寒沙门菌 hfq基因缺失株转录组测序中分析适应环境变化及细菌分泌通路,筛选相关基因.通过使用实时荧光定量 PCR对鼠伤寒沙门菌 hfq基因缺失株转录组测序结果进行验证,从而对鼠伤寒沙门菌 hfq基因缺失株的细菌趋化性通路、细菌双组分通路、细菌分泌通路进行深入分析,筛选相关的重要调控基因.结果显示:在细菌趋化性通路中筛选出 yiaD、STM3138 、STM3216和 malE等 4个共表达基因;在细菌分泌通路中筛选出φaP 、invA、ρrgH、invE、spaS、invG和 ssaV等 7个共表达基因;在细菌双组分通路中筛选出 ybfM、htrA、pagO、STM3138 、STM3031 、ttrB 、hiLD、pstS、STM1530 、hilA、ρgtC、hydH、ρd 、STM3216 、ttrR和 fljB等 16个共表达基因.在鼠伤寒沙门菌 hfq基因缺失株的趋化性通路、细菌双组分通路、细菌分泌通路中筛选出差异表达基因,hfq能够对这些基因进行调控,从而影响如运动性、毒力等相关作用,为沙门菌中的 sRNA与 hfq后续研究及沙门菌的防治奠定一定基础.