微卫星多态性和重复序列PCR分析技术在热带假丝酵母菌基因分型中的应用

• 作者: 彭奕冰 李贞 汪国庆
• 来源期刊: 诊断学理论与实践
• 学科: 医学
• 关键词: 热带假丝酵母菌 基因分型 重复序列PCR 微卫星多态性技术
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 77-81
• 页数: 5页
• 分类号: R372
• 语种: 中文
• DOI: 10.16150/j.1671-2870.2019.01.015

摘要

目的:评估微卫星多态性分析技术和重复序列PCR分析技术在临床热带假丝酵母菌基因分型中的应用.方法:收集2014年8月到2015年11月来自上海4家医院临床分离的热带假丝酵母菌共50株,分别以Ca21、Ca22、Com21两两组合为引物,选用最合适的引物组合进行重复序列聚合酶链反应(repetitive extragenic palindromic polymerase chain reaction,REP-PCR)后电泳获得REP-PCR分型.采用Ctrm1、Ctrm10、Ctrm12这3种微卫星标记进行微卫星多态性分析.比较2种基因分型方法的结果和分辨力.结果:REP-PCR以Ca21-Com21引物组合的分型效果最好,50株热带假丝酵母菌经REP-PCR分型得到共7种REP-PCR型,鉴别力指数(index of discriminatory power,DP)为0.75.经多态性分型得30种基因型,DP为0.97.结论:微卫星多态性分析简便、快捷,分辨力高于REP-PCR检测,可作为实验室基因分型的首选方法.