基于生物信息学途径挖掘防治急性高原病的潜在药物

• 作者: 冯振龙 崔庆华 施冰 李俊峡
• 来源期刊: 中国临床保健杂志
• 关键词: 高原病 低氧 计算生物学 药物评价,临床前 数据挖掘
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 503-507
• 页数: 5页
• 字数: 4359字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/J.issn.1672-6790.2019.04.019

摘要

目的 应用生物信息学途径挖掘潜在的防治急性高原病的药物.方法 选取急性高原低氧暴露7 d大鼠心肌组织标本,进行全转录组高通量测序,筛选差异表达mRNA.应用生物信息学工具Connectivity Map,整合差异表达mRNA信息,推测急性高原低氧心肌损伤差异基因与药物小分子功能的关系,筛选潜在的具有防治急性高原低氧心肌损伤效应的药物.结果 高通量测序结果显示,与常压常氧对照组比较,急性高原低氧暴露大鼠心肌组织中1084个mRNA表达水平发生显著变化.其中457个mRNA表达上调,627个mRNA表达下调.通过connectivity map药物数据库比对分析,发现小分子化合物SB203580负性富集分数较高,是潜在的防治急性高原病的药物.动物实验提示SB203580可减轻高原低氧大鼠心肌水肿和心肌组织病理损伤,下调心肌AQP1mRNA表达.结论 通过生物信息学方法可挖掘出潜在的防治急性高原病的药物,研究方法合理、简便、省时,减少了药物开发研究的盲目性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李俊峡	中国人民解放军总医院第七医学中心干一科	20	48	4.0	6.0
2	崔庆华	北京大学医学部生物信息学系	10	36	4.0	6.0
3	施冰	中国人民解放军总医院第七医学中心干一科	3	1	1.0	1.0
4	冯振龙	安徽医科大学研究生院	3	1	1.0	1.0