牦牛MSMB基因的克隆及其生物信息学分析

• 作者: 何向东 刘宇 夏忆 字向东 陈莹
• 来源期刊: 中国草食动物科学
• 学科: 农学
• 关键词: 牦牛 MSMB基因 基因克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 遗传育种与繁殖
• 页码范围: 1-5,22
• 页数: 6页
• 分类号: S823.8+5
• 字数: 4595字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-3887.2019.05.001

摘要

微精原蛋白β(MSMB)对动物的繁殖功能具有重要的调控作用.采集成年健康母牦牛的卵巢组织,通过RT-PCR技术克隆牦牛的MSMB基因,并进行了生物信息学分析.结果表明:牦牛MSMB基因CDS区长117 bp,编码38个氨基酸;MSMB蛋白分子式C194H308N50O59S4,理论等电点7.69,分子质量4.4 ku,脂肪系数66.58,不稳定系数21.23,属于稳定蛋白质,半衰期30 h,不具有跨膜结构和信号肽,是亲水性蛋白;与黄牛MSMB基因对比发现,牦牛MSMB基因存在1处碱基突变;牦牛与黄牛和绵羊CDS区核苷酸同源性均在80％以上,说明MSMB基因在进化中保守;MEGA 6.0和Clustal X软件分析结果表明,牦牛与黄牛首先聚为一小类,其次与绵羊、小鼠和大鼠聚为一类,最终与猪、鸡和鱼聚为一类,符合物种进化规律,进化树与同源性比对结果相符;二级结构α螺旋、延长链、β-转角和无规卷曲,分别占13.16％、44.74％、13.16％、28.95％,二级结构与三级结构相符;预测MSMB蛋白其结构域是PSP94超家族成员.该实验结果为进一步研究牦牛MSMB基因功能提供了一定理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	字向东	西南民族大学动物科学国家民委重点实验室	81	350	9.0	15.0
2	陈莹	西南民族大学动物科学国家民委重点实验室	13	38	3.0	6.0
3	刘宇	西南民族大学动物科学国家民委重点实验室	3	1	1.0	1.0
4	何向东	西南民族大学动物科学国家民委重点实验室	10	3	1.0	1.0
5	夏忆	西南民族大学动物科学国家民委重点实验室	8	3	1.0	1.0