骨桥蛋白在肺癌中的表达情况及其意义

• 作者: 李保林 王雨婷 钟金琼 陈阳明 高艳芳
• 来源期刊: 重庆医学
• 学科: 医学
• 关键词: 肺肿瘤 预后 基因组 骨桥蛋白质
• 年，卷（期）: 2019,（10）
• 所属期刊栏目: 生物信息学
• 页码范围: 1732-1734
• 页数: 3页
• 分类号: R734.2
• 字数: 2340字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-8348.2019.10.027

摘要

目的 研究骨桥蛋白(又称分泌性磷蛋白,spp1)在肺癌中的表达情况及其意义,为今后指导临床治疗、评估患者预后及防治肺癌相关策略及措施提供具有针对性的科学依据.方法 将癌症基因图谱(TCGA)数据库中收集的资料进行处理,通过x2检验比较3种不同肺癌病理类型突变率的差异;在基因综合表达数据库(GEO)的数据GSE19804中,将癌组织与癌旁正常组织的spp1 mRNA进行配对t检验,分析spp1在肺癌中的差异表达情况;在数据GSE30219中,将293例肺癌组织标本先进行单因素log-Rank生存分析,再使用COX模型校正TNM分期因素,进一步通过方差分析或相关分析,分析spp1与TNM分期、性别、年龄之间的关系.结果 从TCGA等数据库收集了3 148例肺癌研究数据,得出在鳞状细胞癌中,spp1的突变率的均值为0.01;在肺腺癌中,spp1的突变率的均值为0.00;在小细胞癌中,spp1的突变率的均值为0.02;在Pan-Cancer中的突变率是0.01,不同类型肺癌突变率差异无统计学意义(x2=5.64,P＞0.05).从GEO中获得的数据GSE19804,配对t检验结果表明,与癌旁正常组织相比,肺癌组织中的spp1 mRNA表达显著上调(t=13.63,d f=59,P＜0.01);在肿瘤组织中spp1与远处转移(M分期)、淋巴结受累程度和范围(N分期)、年龄呈正相关,与肿瘤大小分级(T分期)和性别无明显关系.结论 spp1在一定程度上影响着肺癌的发生与发展,有望成为肺癌基因诊断、治疗及预后的靶点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	高艳芳	赣南医学院预防医学系	27	68	3.0	8.0
2	李保林	赣南医学院法医学系	7	18	2.0	4.0
3	钟金琼	赣南医学院第一附属医院检验科	2	0	0.0	0.0
4	王雨婷	赣南医学院预防医学系	2	0	0.0	0.0
5	陈阳明	赣南医学院预防医学系	1	0	0.0	0.0