溃疡性结肠炎患者结肠黏膜基因表达谱生物信息学分析

• 作者: 丁一 刘天龙 封小娜 彭波 李颖 熊迪 王文军 贺巍
• 来源期刊: 解放军医药杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 溃疡性结肠炎 生物信息学 差异基因 炎症反应
• 年，卷（期）: 2019,（11）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 50-55
• 页数: 6页
• 分类号: R574.1
• 字数: 3766字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-140X.2019.11.012

摘要

目的 本研究拟用生物信息学方法 ,对溃疡性结肠炎患者结肠黏膜的基因表达谱数据进行深入挖掘分析,以期筛选潜在的病理机制和治疗靶点.方法基因芯片原始数据来自于GEO公共数据库,编号为GSE65114.共包括12例健康志愿者对照样本和18例溃疡性结肠炎患者样本.原始数据在GCBI分析平台进行处理,首先进行两组间差异基因表达分析,得到的差异基因再进行功能和信号通路富集分析.最后构建信号通路网络和基因共表达网络,筛选核心靶点通路和基因.结果 共得到499个显著性差异基因(包括408个上调和91个下调基因),其中排名第一的是SFRP2基因.功能富集分析结果表明,这些差异基因与免疫和炎症反应密切相关.信号通路网络结果显示,Toll样受体通路处在网络核心位置.基因共表达网络中,COL6A3、IRAK3等基因被确定为核心基因.这些核心通路和基因可能在溃疡性结肠炎的病理中发挥重要作用.结论 溃疡性结肠炎与炎症和免疫反应密切相关,其中Toll样受体通路和SFRP2、COL6A3、IRAK3等基因可能是溃疡性结肠炎重要的致病因素和潜在的治疗靶点.