5种类型鲤鱼线粒体 DNA D-loop 及邻近区段的遗传多样性分析

• 作者: 张兴华 杨建新 王妍 白云 胡莹 董仕 金万昆 高永平
• 来源期刊: 水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 乌克兰鳞鲤 德国镜鲤 框鳞镜鲤 红镜鲤 州河鲤 D-loop 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 研究与应用
• 页码范围: 498-505
• 页数: 8页
• 分类号: S917
• 字数: 4795字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16378/j.cnki.1003-1111.2019.04.009

摘要

采用PCR技术对乌克兰鳞鲤、德国镜鲤、框鳞镜鲤、红镜鲤和州河鲤共97尾个体的线粒体DNAD-loop及邻近区段进行了扩增,经测序后获得碱基顺序排列清晰的DNA片段,长度分别为1342、1343、1344bp.共得到8种单倍型(GenBank序列号为MG786481～MG786483,MG786485～MG786487,KC292935,KC292936).使用Mega6.0软件计算出5个群体的组内及组间遗传距离,并构建邻接系统树.线粒体DNAD-loop及邻近区段、单独D-loop区段的碱基序列分析结果表明,单倍型Ⅰ至Ⅳ为欧洲血统,碱基差异位点数较多,变异程度较高;单倍型Ⅴ至Ⅷ为亚洲血统,碱基差异位点数较少,变异程度较低.在线粒体DNAD-loop及邻近区段内,德国镜鲤组内平均遗传距离为0.00462,核苷酸多样性指数为0.00458,平均核苷酸差异性为6.150,遗传多样性最大;州河鲤组内的平均遗传距离为0.00065,核苷酸多样性指数为0.00065,平均核苷酸差异性为0.870,遗传多样性最低.