大豆Argonaute4的生物信息学分析

• 作者: 张天旭 曹乐生 王晗慧 解莉楠
• 来源期刊: 大豆科学
• 关键词: 大豆 AGO4 生物信息学 DNA甲基化
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 种质资源·遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 25-34
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.11861/j.issn.1000-9841.2019.01.0025

摘要

在RNA介导的DNA甲基化途径(RNA-directed DNA methylation pathway)中,Argonaute4(AGO4)蛋白是DNA被甲基化修饰的关键蛋白.研究大豆中Argonaute4蛋白能够为大豆甲基化研究奠定基础,本研究参考NCBI、Phyto-zome、UniProt KB等网站及数据库,对拟南芥的AGO4基因进行同源性分析,确定了大豆中AGO4蛋白及其基因序列,并对其进行分析预测.研究发现,大豆中AGO4包括3个基因GmA GO4A、GmAGO4、GmAGO4C,它们的一级结构、二级结构及理化性质都很相似,三级结构有差异,大豆AGO4C与拟南芥AGO4结构更相似.在302个野生大豆品系中对GmAGO4的3个基因的外显子进行核酸及蛋白序列的分析,发现一些大豆品系的蛋白质由于突变三维结构发生了变化.对大豆中AGO4及其参与的甲基化途径的研究具有指导意义.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	解莉楠	东北林业大学生命科学学院	33	146	7.0	11.0
2	曹乐生	东北林业大学生命科学学院	1	0	0.0	0.0
3	王晗慧	东北林业大学生命科学学院	1	0	0.0	0.0
4	张天旭	东北林业大学生命科学学院	1	0	0.0	0.0