炎症性肠病肠道微生物整合代谢网络的构建与分析

• 作者: 周贤斌 季新荣 曹洋 沈玲燕 沈陈波
• 来源期刊: 军事医学
• 学科: 医学
• 关键词: 炎症性肠病 整合代谢网络 拓扑属性 肠道微生物
• 年，卷（期）: 2019,（7）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 522-527
• 页数: 6页
• 分类号: R574.62
• 字数: 4597字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7644/j.issn.1674-9960.2019.07.008

摘要

目的 构建炎症性肠病(IBD)肠道微生物整合代谢网络,比较分析IBD整合代谢网络的拓扑变化.方法参考KEGG数据库,根据肠道微生物参与的代谢反应构建整合代谢网络,用KO丰度差异abs(log2 OR)评估KO与机体状态的关联,丰度差异>1的KO即为IBD相关KO,分析IBD相关KO与网络节点的介数中心度、聚类系数和度的关联,并比较IBD和健康整合代谢网络的模块化程度、稳定性和密度.结果构建了含1300个节点(KO)的整合代谢网络;发现366个KO与IBD相关(254个高表达,112个低表达);IBD相关的KO介数中心度和度显著小于IBD无关的KO,聚类系数显著大于IBD无关KO;IBD减少网络的模块化程度、稳定性和密度.结论IBD引起整合代谢网络拓扑属性的变化,IBD相关的KO倾向于在网络的边缘,整合代谢网络方法可从整体上解释肠道微生物变化与IBD的本质关联.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	沈玲燕		6	14	3.0	3.0
2	沈陈波		1	0	0.0	0.0
3	季新荣		3	5	2.0	2.0
4	曹洋	军事科学院军事医学研究院环境医学与作业医学研究所	1	0	0.0	0.0