大豆2S清蛋白基因生物信息学分析

• 作者: 王曙明 王洋 王跃强 王迪 邱红梅 郑大浩 马晓萍 高淑芹
• 来源期刊: 大豆科学
• 关键词: 大豆 LTP 进化分析 差异表达
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 种质资源·遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 16-24
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.11861/j.issn.1000-9841.2019.01.0016

摘要

2S清蛋白含有动物胰蛋白酶抑制剂及过敏原等多种具有生理活性的多肽,可引起特殊人群尤其是儿童的过敏反应,其编码基因为LTP基因家族.为系统地分析2S清蛋白编码基因,利用生物信息学分析方法获得2S清蛋白基因的全序列、定位以及转录本等信息,鉴定了30个大豆LTP家族基因.基因定位结果表明:23.33％基因在染色体上串联排布,反映了该家族基因的串联重复进化.通过基因功能注释得到22个非特异性脂质转运蛋白,1个类伸展素蛋白,4个脯氨酸蛋白,2个种子储存2S清蛋白和1个雄蕊特殊蛋白.根据系统发育分析将这些蛋白分成3个类群.类群Ⅰ有类伸展素蛋白、脯氨酸蛋白、雄蕊特殊蛋白和种子储存2S清蛋白,类群Ⅱ有16个非特异性脂质转运蛋白,类群Ⅲ有6个非特异性脂肪转移蛋白.种子储存2S清蛋白基因在种子发育中后期特异表达,表达量显著高于其它同源基因.本研究为进一步研究其功能提供指导,为该类基因应用于大豆品质改良提供理论支撑.