肺鳞状细胞癌特异性甲基化候选诊断标志物的识别

• 作者: 尚文慧 常宇 李晓琴 王学栋
• 来源期刊: 生物化学与生物物理进展
• 学科: 生物学
• 关键词: DNA甲基化 特异性标志物 肺鳞状细胞癌 早期诊断
• 年，卷（期）: 2019,（7）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 680-688
• 页数: 9页
• 分类号: Q7|Q8
• 语种: 中文
• DOI: 10.16476/j.pibb.2019.0050

摘要

甲基化异常是肿瘤早期的频发事件,DNA甲基化随着时间的推移相对稳定,并且可以在血液中非侵入性地检测到,因此DNA甲基化具有成为癌症早期诊断生物标志物的巨大潜力.为了找到肺鳞状细胞癌(LUSC)潜在的诊断标志物,本文提出了一种LUSC特异性候选诊断标志物的识别方法,使用癌症基因组图谱数据库(TCGA)的LUSC的甲基化数据集,通过比较LUSC与正常肺组织和其他癌症类型,得到了6个LUSC特异性甲基化位点,使用支持向量机建立诊断模型,采用六折交叉划分数据集,验证特异性标志物的有效性.6个标志物的组合在预测LUSC方面达到约93％～99％的灵敏度,在排除正常组织时达到100％的特异性,在排除其他癌症时达到约99％的特异性.我们的研究为LUSC的早期诊断提供了潜在的生物标志物.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	常宇		34	87	5.0	7.0
2	李晓琴		28	71	5.0	6.0
3	王学栋		3	0	0.0	0.0
4	尚文慧		2	0	0.0	0.0