干旱胁迫下野生大豆ABC转运蛋白转录组测序分析

• 作者: 乔亚科 张小芳 张锴 徐燕 李桂兰 王冰冰
• 来源期刊: 核农学报
• 关键词: 野生大豆 转录组测序 干旱胁迫 ABC转运蛋白
• 年，卷（期）: 2019,（8）
• 所属期刊栏目: 植物诱变育种·农业生物技术
• 页码范围: 1474-1482
• 页数: 9页
• 字数: 5510字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11869/j.issn.100-8551.2019.08.1474

摘要

为获取干旱胁迫状态下ABC转运蛋白家族相关基因,以抗旱性强的野生大豆为试验材料,浇灌20％PEG 6000模拟干旱胁迫,分别在干旱处理0、6、12、24和48 h后取叶片提取RNA进行转录组测序;以GO、KEGG和NR三大数据库注释的结果为基础,再以ABC转运蛋白为关键词进行筛选.结果 表明,共获得337条ABC转运蛋白相关序列,包括8大亚家族(ABCA、ABCB、ABCC、ABCD、ABCE、ABCF、ABCG和ABCI).差异表达分析结果表明,共有182条表现差异表达.GO注释到的差异表达基因多数为嘌呤核苷酸分解过程,KEGG注释到的差异表达基因分布在5个亚家族(ABCA、ABCB、ABCC、ABCD和ABCG).对NR数据库有注释的168条差异表达基因进行进化分析,结果表明ABCE、ABCF、ABCG家族与ABCI11为一类,ABCB、ABCC家族与ABCI10为一类,ABCA、ABCD家族与ABCI19为一类.本研究为进一步研究野生大豆干旱胁迫下ABC转运蛋白抗旱基因提供了一定的理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李桂兰	河北科技师范学院农学与生物科技学院	14	117	5.0	10.0
2	乔亚科	河北科技师范学院农学与生物科技学院	20	132	6.0	11.0
3	徐燕	河北科技师范学院农学与生物科技学院	2	0	0.0	0.0
4	张锴	河北科技师范学院农学与生物科技学院	8	13	2.0	3.0
5	张小芳	河北科技师范学院农学与生物科技学院	3	0	0.0	0.0
6	王冰冰	河北科技师范学院农学与生物科技学院	1	0	0.0	0.0