西昌华吸鳅的微卫星引物筛选及赤水河四个地理种群的 遗传多样性分析

• 作者: 俞丹 刘焕章 刘飞 张智
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 西昌华吸鳅 微卫星 引物筛选 遗传多样性 遗传分化
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 页码范围: 1224-1230
• 页数: 7页
• 分类号: Q346+.5
• 字数: 3441字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7541/2019.145

摘要

采用高通量测序法对西昌华吸鳅(Sinogastromyzon sichangensis)基因组进行随机测序并筛选出符合条件的微卫星位点,设计可用于PCR扩增的引物,筛选出29对具有多态性的引物,平均等位基因数为14.5,观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)分别为0.620和0.882,多态信息含量(PIC)为0.859.选取其中多态性较高的20对引物在赤水河及其支流的4个地理种群中进行扩增,分析不同地理种群的遗传多样性和种群分化情况.结果表明,赤水镇种群观测杂合度最高(0.669),茅台镇种群观测杂合度最低(0.520);习水河多态信息含量最高(0.868),茅台镇种群多态信息含量最低(0.841).赤水河干流的几个种群未出现显著分化,而习水河种群与其他3个种群的遗传分化程度较高.AMOVA分析显示遗传变异主要发生在群体内,群体间遗传变异仅占3.33％,群体内遗传变异占96.67％.种群遗传结构分析表明,赤水河干流整体遗传背景趋于一致,而习水河种群则单独聚为一个亚类群.研究为西昌华吸鳅的资源保护和种群遗传学研究提供了基础资料.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘飞	中国科学院水生生物研究所水生生物多样性与保护重点实验室	71	509	12.0	19.0
2	刘焕章	中国科学院水生生物研究所水生生物多样性与保护重点实验室	71	1282	19.0	34.0
3	张智	中国科学院水生生物研究所水生生物多样性与保护重点实验室	12	65	4.0	8.0
7	俞丹	中国科学院水生生物研究所水生生物多样性与保护重点实验室	8	29	3.0	5.0