地黄SCoT分子标记体系的建立和指纹图谱的构建

• 作者: 周延清 杨珂 段红英 郭萌萌
• 来源期刊: 广西植物
• 学科: 物理学
• 关键词: 目标起始密码子多态性( SCoT) 单因素试验 正交设计 引物筛选 品种鉴定
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 植物系统与进化
• 页码范围: 608-614
• 页数: 7页
• 分类号: Q949.9|O413
• 字数: 4119字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11931/guihaia.gxzw201808008

摘要

该研究采用L25(56)正交设计和单因素两种方法,对影响地黄SCoT-PCR反应的5个因素(模板DNA浓度,引物浓度,ddH2 O和Mix的用量以及退火温度)进行了优化.结果表明:优化后的反应体系总体积为25μL,含有8μL ddH2O,1μL模板DNA(80 ng·μL-1),1μL引物(8μmol·L-1)和15μL Mix,退火温度为45℃.运用30份地黄种质材料,对优化的SCoT-PCR正交体系进行多次重复验证,获得了多态性丰富、条带清晰的扩增图谱,证明该反应体系稳定可靠.利用该体系对32条SCoT引物进行两次筛选,得到14个扩增产物清晰、重复性好且多态性条带相对较高的引物.利用SCoT4等5条引物构建了上述地黄2个种共30份种质的SCoT指纹图谱.利用这5个SCoT引物指纹图谱可将7个地黄常用栽培品种区分开.这表明SCoT分子标记体系适用于地黄主要品种亲缘关系及遗传多样性的研究,所构建的指纹图谱也为地黄常见的7个栽培品种的区分提供参考依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周延清	河南师范大学生命科学学院	85	1261	15.0	33.0
4	段红英	河南师范大学生命科学学院	45	382	11.0	16.0
5	杨珂	河南师范大学生命科学学院	6	15	3.0	3.0
6	郭萌萌	河南师范大学生命科学学院	6	4	1.0	2.0