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摘要:
尖孢镰刀菌古巴专化型Fusarium oxysporum f.sp.cubense(FOC)是威胁香蕉生产的重要土传病原真菌.丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK) FoSlt2信号通路在调控尖孢镰刀菌古巴专化型的生长发育、细胞壁完整性和致病性方面发挥着重要作用.为了揭示FoSlt2信号通路的致病机理和寻找农药靶标,本研究利用高通量RNA-seq技术对该病菌野生型菌株和FoSlt2敲除突变体菌株的转录组进行了比较分析,结果表明差异表达基因共有2 164个,其中上调表达基因有1 184个,下调表达基因有980个.Gene Ontology (GO)功能分析结果表明,差异表达基因主要参与在结合、催化分子功能组和代谢过程、细胞过程生物学通路中.KEGG功能富集分析结果表明,差异基因主要参与戊糖和葡糖醛酸盐转换、氨基糖和核苷酸糖、氨基葡聚糖降解、磷酸肌醇和碳类物质代谢通路,说明这些通路与尖孢镰刀菌古巴专化型的生长发育和致病性相关.该研究为尖孢镰刀菌古巴专化型致病机制的阐明奠定了理论基础.
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文献信息
篇名 尖孢镰刀菌古巴专化型MAPK FoSlt2敲除突变体的转录组分析
来源期刊 菌物学报 学科
关键词 香蕉枯萎病 尖孢镰刀菌古巴专化型 高通量测序 差异表达基因
年,卷(期) 2019,(7) 所属期刊栏目 研究论文
研究方向 页码范围 1090-1098
页数 9页 分类号
字数 语种 中文
DOI 10.13346/j.mycosystema.190076
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 陈丽霞 琼台师范学院生物教研室 23 63 5.0 6.0
2 许天委 琼台师范学院生物教研室 21 37 4.0 5.0
3 吴小霞 琼台师范学院生物教研室 25 20 3.0 3.0
4 孙君梅 琼台师范学院生物教研室 13 19 3.0 3.0
5 傅琪彦 海南职业技术学院热带农业技术学院 2 0 0.0 0.0
6 丁兆建 琼台师范学院生物教研室 9 1 1.0 1.0
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研究主题发展历程
节点文献
香蕉枯萎病
尖孢镰刀菌古巴专化型
高通量测序
差异表达基因
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
菌物学报
月刊
1672-6472
11-5180/Q
16开
北京市朝阳区北辰西路1号院3号中国科学院微生物研究所B401
2-499
1982
chi
出版文献量(篇)
3221
总下载数(次)
8
总被引数(次)
34143
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
论文1v1指导