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尖孢镰刀菌古巴专化型MAPK FoSlt2敲除突变体的转录组分析
尖孢镰刀菌古巴专化型MAPK FoSlt2敲除突变体的转录组分析
作者:
丁兆建
傅琪彦
吴小霞
孙君梅
许天委
陈丽霞
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
香蕉枯萎病
尖孢镰刀菌古巴专化型
高通量测序
差异表达基因
摘要:
尖孢镰刀菌古巴专化型Fusarium oxysporum f.sp.cubense(FOC)是威胁香蕉生产的重要土传病原真菌.丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK) FoSlt2信号通路在调控尖孢镰刀菌古巴专化型的生长发育、细胞壁完整性和致病性方面发挥着重要作用.为了揭示FoSlt2信号通路的致病机理和寻找农药靶标,本研究利用高通量RNA-seq技术对该病菌野生型菌株和FoSlt2敲除突变体菌株的转录组进行了比较分析,结果表明差异表达基因共有2 164个,其中上调表达基因有1 184个,下调表达基因有980个.Gene Ontology (GO)功能分析结果表明,差异表达基因主要参与在结合、催化分子功能组和代谢过程、细胞过程生物学通路中.KEGG功能富集分析结果表明,差异基因主要参与戊糖和葡糖醛酸盐转换、氨基糖和核苷酸糖、氨基葡聚糖降解、磷酸肌醇和碳类物质代谢通路,说明这些通路与尖孢镰刀菌古巴专化型的生长发育和致病性相关.该研究为尖孢镰刀菌古巴专化型致病机制的阐明奠定了理论基础.
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穗发芽
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Vp1
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篇名
尖孢镰刀菌古巴专化型MAPK FoSlt2敲除突变体的转录组分析
来源期刊
菌物学报
学科
关键词
香蕉枯萎病
尖孢镰刀菌古巴专化型
高通量测序
差异表达基因
年,卷(期)
2019,(7)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
1090-1098
页数
9页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.13346/j.mycosystema.190076
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
陈丽霞
琼台师范学院生物教研室
23
63
5.0
6.0
2
许天委
琼台师范学院生物教研室
21
37
4.0
5.0
3
吴小霞
琼台师范学院生物教研室
25
20
3.0
3.0
4
孙君梅
琼台师范学院生物教研室
13
19
3.0
3.0
5
傅琪彦
海南职业技术学院热带农业技术学院
2
0
0.0
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6
丁兆建
琼台师范学院生物教研室
9
1
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传播情况
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同被引文献
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尖孢镰刀菌古巴专化型
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差异表达基因
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
菌物学报
主办单位:
中国科学院微生物研究所
中国菌物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1672-6472
CN:
11-5180/Q
开本:
16开
出版地:
北京市朝阳区北辰西路1号院3号中国科学院微生物研究所B401
邮发代号:
2-499
创刊时间:
1982
语种:
chi
出版文献量(篇)
3221
总下载数(次)
8
总被引数(次)
34143
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
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