基于PPI网络预测和验证结直肠癌相关Hub基因

• 作者: 崔雷 范馨月 邵春莹
• 来源期刊: 中华医学图书情报杂志
• 学科: 医学
• 关键词: PPI网络 网络分析 富集分析 功能模块
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 所属期刊栏目: 专题:文本挖掘
• 页码范围: 17-25
• 页数: 9页
• 分类号: TP391.3|R735.3
• 字数: 4509字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-3982.2019.06.003

摘要

目的:通过PPI网络分析确定CRC相关Hub基因,为CRC靶向治疗提供一定参考.方法:从OpenTargets数据库获得CRC相关基因,使用Metascape对基因集进行富集分析,确定基因集富集术语.采用STRING数据库及CytoScape构建PPI网络,采用MCODE寻找PPI网络中的功能模块(子网).根据功能模块中节点的网络属性确定Hub基因,通过文献法和GEPIA数据库对Hub基因进行验证.结果:共得到CXCL8、ERBB2、CYCS 3个Hub基因,它们均与CRC的发生和发展有一定关系,.它们均在CRC组织与正常组织中存在差异表达,并与CRC患者的总体生存时间相关.结论:基于PPI的网络分析可准确预测CRC相关Hub基因和为CRC靶向治疗提供参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	崔雷	中国医科大学医学信息学院	99	853	16.0	23.0
2	邵春莹		5	18	2.0	4.0
3	范馨月		7	1	1.0	1.0